El Campeonato Europeo Sub-16 de la FIBA de 1999 (conocido en aquel entonces como Campeonato Europeo de Cadetes de 1999 ) fue la 15.ª edición del Campeonato Europeo Sub-16 de la FIBA . Las ciudades de Polzela , Celje y Laško , en Eslovenia , fueron las anfitrionas del torneo. Yugoslavia ganó el trofeo por segunda vez consecutiva.
En este torneo se disputaron dos rondas clasificatorias, en las que participaron veinticuatro equipos nacionales. Quince equipos avanzaron a la ronda de desafío, donde se unieron a Grecia , Israel y Francia . Los dieciocho equipos restantes se dividieron en tres grupos de seis equipos cada uno. Los tres primeros equipos de cada grupo se unieron a Yugoslavia (campeón), Rusia (subcampeón) y Eslovenia (anfitrión) en el torneo final.
Los doce equipos fueron divididos en dos grupos de seis equipos cada uno.