Jerarquía de unidades de procesamiento de Blue Gene
Blue Gene fue un proyecto de IBM destinado a diseñar supercomputadoras que puedan alcanzar velocidades operativas en el rango de petaFLOPS (PFLOPS) , con bajo consumo de energía.
El proyecto creó tres generaciones de supercomputadoras, Blue Gene/L , Blue Gene/P y Blue Gene/Q . Durante su implementación, los sistemas Blue Gene a menudo encabezaron las clasificaciones TOP500 [1] y Green500 [2] de las supercomputadoras más potentes y de mayor eficiencia energética, respectivamente. Los sistemas Blue Gene también han obtenido consistentemente las primeras posiciones en la lista Graph500 . [3] El proyecto fue galardonado con la Medalla Nacional de Tecnología e Innovación 2009 . [4]
A partir de 2015, IBM parece haber finalizado el desarrollo de la familia Blue Gene, aunque no se ha hecho ningún anuncio formal. [5] Desde entonces, IBM ha centrado sus esfuerzos en supercomputadoras en la plataforma OpenPower , utilizando aceleradores como FPGA y GPU para abordar los rendimientos decrecientes de la ley de Moore . [6]
Historia
En diciembre de 1999, IBM anunció una iniciativa de investigación de 100 millones de dólares para un esfuerzo de cinco años destinado a construir una computadora masivamente paralela , que se aplicaría al estudio de fenómenos biomoleculares como el plegamiento de proteínas . [7] El proyecto tenía dos objetivos principales: avanzar en nuestra comprensión de los mecanismos detrás del plegamiento de proteínas mediante simulación a gran escala y explorar ideas novedosas en arquitectura y software de máquinas masivamente paralelas. Las principales áreas de investigación incluyeron: cómo utilizar esta novedosa plataforma para cumplir eficazmente sus objetivos científicos, cómo hacer que estas máquinas masivamente paralelas sean más utilizables y cómo lograr objetivos de rendimiento a un costo razonable, a través de novedosas arquitecturas de máquinas. El diseño inicial de Blue Gene se basó en una versión anterior de la arquitectura Cyclops64 , diseñada por Monty Denneau . El trabajo inicial de investigación y desarrollo se llevó a cabo en el Centro de investigación IBM TJ Watson y estuvo dirigido por William R. Pulleyblank . [8]
En IBM, Alan Gara comenzó a trabajar en una extensión de la arquitectura QCDOC a una supercomputadora de uso más general: la red de interconexión del vecino más cercano 4D fue reemplazada por una red que admitía el enrutamiento de mensajes de cualquier nodo a cualquier otro; y se agregó un subsistema de E/S paralelo. El DOE comenzó a financiar el desarrollo de este sistema y pasó a ser conocido como Blue Gene/L (L de Luz); El desarrollo del sistema Blue Gene original continuó bajo el nombre de Blue Gene/C (C de Cyclops) y, más tarde, Cyclops64.
En noviembre de 2004, un sistema de 16 racks , en el que cada rack contenía 1.024 nodos de cómputo, alcanzó el primer lugar en la lista TOP500 , con un rendimiento Linpack de 70,72 TFLOPS. [1] De este modo superó al Earth Simulator de NEC , que había ostentado el título de ordenador más rápido del mundo desde 2002. Desde 2004 hasta 2007, la instalación de Blue Gene/L en LLNL [9] se amplió gradualmente hasta 104 bastidores, alcanzando 478 TFLOPS Linpack y pico de 596 TFLOPS. La instalación LLNL BlueGene/L ocupó la primera posición en la lista TOP500 durante 3,5 años, hasta que en junio de 2008 fue superada por el sistema Cell-based Roadrunner de IBM en el Laboratorio Nacional de Los Álamos , que fue el primer sistema en superar la marca de 1 PetaFLOPS. El sistema fue construido en la planta de IBM de Rochester, MN.
Si bien la instalación de LLNL fue la instalación más grande de Blue Gene/L, le siguieron muchas instalaciones más pequeñas. En noviembre de 2006, había 27 computadoras en la lista TOP500 que utilizaban la arquitectura Blue Gene/L. Todas estas computadoras figuraban en la lista con una arquitectura de eServer Blue Gene Solution . Por ejemplo, en el Centro de Supercomputación de San Diego se alojaron tres bastidores de Blue Gene/L .
Mientras que el TOP500 mide el rendimiento en una única aplicación de referencia, Linpack, Blue Gene/L también estableció récords de rendimiento en un conjunto más amplio de aplicaciones. Blue Gene/L fue la primera supercomputadora en ejecutar más de 100 TFLOPS sostenidos en una aplicación del mundo real, es decir, un código de dinámica molecular tridimensional (ddcMD), que simula la solidificación (procesos de nucleación y crecimiento) de metal fundido bajo alta presión y temperatura. condiciones. Este logro le valió el Premio Gordon Bell 2005 .
En junio de 2006, la NNSA e IBM anunciaron que Blue Gene/L alcanzó 207,3 TFLOPS en una aplicación química cuántica ( Qbox ). [10] En Supercomputing 2006, [11] Blue Gene/L recibió el premio ganador en todas las clases de premios HPC Challenge. [12] En 2007, un equipo del Centro de Investigación IBM Almaden y la Universidad de Nevada ejecutaron una red neuronal artificial casi la mitad de compleja que el cerebro de un ratón durante el equivalente a un segundo (la red se ejecutó a 1/10 de velocidad normal durante 10 segundos). [13]
El nombre
El nombre Blue Gene proviene de la función para la que fue diseñado originalmente: ayudar a los biólogos a comprender los procesos de plegamiento de proteínas y desarrollo de genes . [14] "Azul" es un apodo tradicional que IBM utiliza para muchos de sus productos y para la propia empresa . El diseño original de Blue Gene pasó a llamarse "Blue Gene/C" y, finalmente, Cyclops64 . La "L" en Blue Gene/L proviene de "Light", ya que el nombre original de ese diseño era "Blue Light". La versión "P" fue diseñada para ser un diseño de petaescala . "Q" es sólo la letra después de "P". No existe el gen azul/R. [15]
Características principales
La supercomputadora Blue Gene/L fue única en los siguientes aspectos: [16]
Cambiando la velocidad de los procesadores por un menor consumo de energía. Blue Gene/L utilizó núcleos PowerPC integrados de baja frecuencia y baja potencia con aceleradores de punto flotante. Si bien el rendimiento de cada chip era relativamente bajo, el sistema podía lograr una mejor eficiencia energética para aplicaciones que podían utilizar una gran cantidad de nodos.
Procesadores duales por nodo con dos modos de trabajo: modo coprocesador donde un procesador maneja el cálculo y el otro maneja la comunicación; y modo de nodo virtual, donde ambos procesadores están disponibles para ejecutar código de usuario, pero los procesadores comparten tanto la carga de cálculo como de comunicación.
Diseño de sistema en un chip. Los componentes se integraron en un solo chip para cada nodo, con la excepción de 512 MB de DRAM externa.
Una gran cantidad de nodos (escalable en incrementos de 1024 hasta al menos 65,536)
Interconexión de toros tridimensionales con redes auxiliares para comunicaciones globales (difusión y reducciones), E/S y gestión.
Sistema operativo liviano por nodo para una sobrecarga mínima del sistema (ruido del sistema).
Arquitectura
La arquitectura Blue Gene/L fue una evolución de las arquitecturas QCDSP y QCDOC . Cada nodo de E/S o Compute Blue Gene/L era un único ASIC con chips de memoria DRAM asociados . El ASIC integró dos procesadores integrados PowerPC 440 de 700 MHz, cada uno con una unidad de punto flotante (FPU) de doble canalización y doble precisión , un subsistema de caché con controlador DRAM incorporado y la lógica para admitir múltiples subsistemas de comunicación. . Las FPU duales dieron a cada nodo Blue Gene/L un rendimiento máximo teórico de 5,6 GFLOPS (gigaFLOPS) . Las dos CPU no eran coherentes en caché entre sí.
Los nodos de cómputo se empaquetaron en dos por tarjeta de cómputo, con 16 tarjetas de cómputo más hasta 2 nodos de E/S por placa de nodo. Había 32 placas de nodos por gabinete/bastidor. [17] Mediante la integración de todos los subsistemas esenciales en un solo chip y el uso de lógica de bajo consumo, cada nodo de Computación o E/S disipaba baja potencia (alrededor de 17 vatios, incluidas las DRAM). Esto permitió un empaquetado agresivo de hasta 1024 nodos de cómputo, además de nodos de E/S adicionales, en un rack estándar de 19 pulgadas , dentro de límites razonables de suministro de energía eléctrica y refrigeración por aire. Las métricas de rendimiento, en términos de FLOPS por vatio , FLOPS por m 2 de superficie y FLOPS por costo unitario, permitieron escalar hasta un rendimiento muy alto. Con tantos nodos, las fallas de los componentes eran inevitables. El sistema pudo aislar eléctricamente los componentes defectuosos, hasta una granularidad de medio bastidor (512 nodos de cómputo), para permitir que la máquina continuara funcionando.
Cada nodo Blue Gene/L estaba conectado a tres redes de comunicaciones paralelas: una red toroidal 3D para la comunicación entre pares entre nodos informáticos, una red colectiva para la comunicación colectiva (transmisiones y operaciones reducidas) y una red de interrupción global para barreras rápidas. . Los nodos de E/S, que ejecutan el sistema operativo Linux , proporcionaban comunicación al almacenamiento y a los hosts externos a través de una red Ethernet . Los nodos de E/S manejaban las operaciones del sistema de archivos en nombre de los nodos de computación. Finalmente, una red Ethernet privada e independiente proporcionó acceso a cualquier nodo para configuración, arranque y diagnóstico. Para permitir que se ejecuten múltiples programas simultáneamente, un sistema Blue Gene/L podría dividirse en conjuntos de nodos aislados electrónicamente. El número de nodos en una partición tenía que ser una potencia entera positiva de 2, con al menos 2 ·5 = 32 nodos. Para ejecutar un programa en Blue Gene/L, primero debía reservarse una partición del ordenador. Luego, el programa se cargó y ejecutó en todos los nodos dentro de la partición, y ningún otro programa pudo acceder a los nodos dentro de la partición mientras estaba en uso. Al finalizar, los nodos de partición se liberaron para su uso en futuros programas.
Los nodos informáticos Blue Gene/L utilizaban un sistema operativo mínimo que admitía un único programa de usuario. Solo se admitía un subconjunto de llamadas POSIX y solo se podía ejecutar un proceso a la vez en el nodo en modo coprocesador, o un proceso por CPU en modo virtual. Los programadores necesitaban implementar subprocesos verdes para simular la concurrencia local. El desarrollo de aplicaciones generalmente se realizaba en C , C++ o Fortran utilizando MPI para la comunicación. Sin embargo, algunos lenguajes de programación como Ruby [18] y Python [19] se han portado a los nodos de computación.
IBM publicó aquí BlueMatter, la aplicación desarrollada para ejercitar Blue Gene/L, como código abierto. [20] Esto sirve para documentar cómo las aplicaciones utilizaron el toro y las interfaces colectivas, y puede servir como base para que otros ejerciten la generación actual de supercomputadoras.
Gen azul/P
Una tarjeta de nodo Blue Gene/PUna descripción esquemática de una supercomputadora Blue Gene/P
En junio de 2007, IBM presentó Blue Gene/P , la segunda generación de la serie de supercomputadoras Blue Gene y fue diseñada a través de una colaboración que incluyó a IBM, LLNL y Leadership Computing Facility del Laboratorio Nacional Argonne . [21]
Diseño
El diseño de Blue Gene/P es una evolución tecnológica de Blue Gene/L. Cada chip Blue Gene/P Compute contiene cuatro núcleos de procesador PowerPC 450 , que funcionan a 850 MHz. Los núcleos son coherentes con la caché y el chip puede funcionar como un multiprocesador simétrico de 4 vías (SMP). El subsistema de memoria del chip consta de pequeños cachés L2 privados, un caché L3 central compartido de 8 MB y dos controladores de memoria DDR2 . El chip también integra la lógica para la comunicación de nodo a nodo, utilizando las mismas topologías de red que Blue Gene/L, pero con más del doble de ancho de banda. Una tarjeta informática contiene un chip Blue Gene/P con 2 o 4 GB de DRAM, que comprende un "nodo informático". Un solo nodo informático tiene un rendimiento máximo de 13,6 GFLOPS. 32 tarjetas de cómputo están conectadas a una placa de nodo enfriada por aire. Un bastidor contiene 32 placas de nodos (es decir, 1024 nodos, 4096 núcleos de procesador). [22]
Al utilizar muchos chips pequeños, de bajo consumo y densamente empaquetados, Blue Gene/P superó la eficiencia energética de otras supercomputadoras de su generación, y con 371 MFLOPS/W, las instalaciones de Blue Gene/P se ubicaron en o cerca de la cima de la clasificación. Listas Green500 en 2007-2008. [2]
Instalaciones
La siguiente es una lista incompleta de instalaciones de Blue Gene/P. En noviembre de 2009, la lista TOP500 contenía 15 instalaciones de Blue Gene/P de 2 bastidores (2048 nodos, 8192 núcleos de procesador, 23,86 TFLOPS Linpack ) y más grandes. [1]
El 12 de noviembre de 2007, la primera instalación de Blue Gene/P, JUGENE , con 16 racks (16.384 nodos, 65.536 procesadores) estaba funcionando en Forschungszentrum Jülich en Alemania con un rendimiento de 167 TFLOPS. [23] Cuando se inauguró, era el superordenador más rápido de Europa y el sexto más rápido del mundo. En 2009, JUGENE se actualizó a 72 racks (73.728 nodos, 294.912 núcleos de procesador) con 144 terabytes de memoria y 6 petabytes de almacenamiento, y logró un rendimiento máximo de 1 PetaFLOPS. Esta configuración incorporó nuevos intercambiadores de calor aire-agua entre los bastidores, lo que redujo sustancialmente el costo de enfriamiento. [24] JUGENE fue cerrado en julio de 2012 y reemplazado por el sistema Blue Gene/Q JUQUEEN .
El sistema "Intrepid" de 40 racks (40960 nodos, 163840 núcleos de procesador) del Laboratorio Nacional Argonne ocupó el puesto número 3 en la lista Top 500 de junio de 2008. [25] El sistema Intrepid es uno de los principales recursos del programa INCITE, en el que se otorgan horas de procesador a proyectos de ciencia e ingeniería de "gran desafío" en una competencia revisada por pares.
Un sistema Blue Gene/P de 2,5 racks es el procesador central del proyecto Low Frequency Array for Radioastronomy ( LOFAR ) en los Países Bajos y los países europeos circundantes. Esta aplicación utiliza las capacidades de transmisión de datos de la máquina.
En 2011, se instaló un Blue Gene/P de 2 bastidores en la Universidad de Canterbury en Christchurch, Nueva Zelanda.
En 2012, se instaló un Blue Gene/P de 2 bastidores en la Universidad de Rutgers en Piscataway, Nueva Jersey. Fue apodado "Excalibur" como un homenaje a la mascota de Rutgers, el Caballero Escarlata. [29]
El primer Blue Gene/P en la región de la ASEAN se instaló en 2010 en el centro de investigación de la Universidad de Brunei Darussalam , el Centro UBD-IBM . La instalación ha impulsado la colaboración de investigación entre la universidad e IBM sobre modelado climático que investigará el impacto del cambio climático en el pronóstico de inundaciones, el rendimiento de los cultivos, la energía renovable y la salud de los bosques tropicales de la región, entre otros. [31]
En 2013, se donó un Blue Gene/P de 1 bastidor al Departamento de Ciencia y Tecnología para pronósticos meteorológicos, gestión de desastres, agricultura de precisión y salud. Está ubicado en el Centro Nacional de Computación, Diliman, Quezon City, bajo los auspicios de Instalación central de bioinformática (CFB) del Centro Filipino del Genoma (PGC) en UP Diliman, Quezon City. [32]
Aplicaciones
Veselin Topalov , el retador al título de Campeón Mundial de Ajedrez en 2010, confirmó en una entrevista que había utilizado una supercomputadora Blue Gene/P durante su preparación para el partido. [33]
La computadora Blue Gene/P se ha utilizado para simular aproximadamente el uno por ciento de la corteza cerebral humana, que contiene 1.600 millones de neuronas con aproximadamente 9 billones de conexiones. [34]
El equipo del proyecto IBM Kittyhawk ha portado Linux a los nodos informáticos y ha demostrado cargas de trabajo genéricas Web 2.0 ejecutándose a escala en un Blue Gene/P. Su artículo, publicado en ACM Operating Systems Review, describe un controlador de kernel que hace un túnel Ethernet a través de la red del árbol, lo que da como resultado una conectividad TCP/IP de todos a todos . [35] [36] Al ejecutar software estándar de Linux como MySQL , sus resultados de rendimiento en SpecJBB se encuentran entre los más altos registrados. [ cita necesaria ]
En 2011, un equipo de la Universidad de Rutgers, IBM y la Universidad de Texas vinculó la instalación de KAUST Shaheen con una instalación de Blue Gene/P en el Centro de Investigación Watson de IBM en una "nube informática federada de alto rendimiento", ganando el desafío IEEE SCALE 2011 con un Aplicación de optimización de yacimientos de petróleo. [37]
El tercer diseño de supercomputadora de la serie Blue Gene, Blue Gene/Q, tiene un rendimiento máximo de 20 petaflops , [38] alcanzando el rendimiento de referencia de LINPACK de 17 petaflops . Blue Gene/Q continúa expandiendo y mejorando las arquitecturas Blue Gene/L y /P.
Diseño
El "nodo de cálculo" de Blue Gene/Q consta de un chip que contiene varios núcleos de procesador A2 de 64 bits . Cada código de procesador es multiproceso de 4 vías simultáneamente , funciona a 1,6 GHz y tiene una unidad de punto flotante de doble precisión SIMD de cuatro vectores (IBM QPX). Cada chip informático contiene 18 núcleos. Se utilizan 16 núcleos de procesador para la informática de aplicaciones; un núcleo 17 maneja funciones de asistencia del sistema operativo como interrupciones , E/S asíncronas , estimulación MPI y RAS ; y el núcleo 18 es sólo un repuesto de fabricación redundante que se utiliza para aumentar el rendimiento. El núcleo sobrante posiblemente no funcional se desactiva antes de la operación del sistema. Los núcleos del procesador del chip están conectados mediante un interruptor de barra transversal a una caché eDRAM L2 de 32 MB, que funciona a la mitad de la velocidad del núcleo. La caché L2 tiene múltiples versiones (admite memoria transaccional y ejecución especulativa ) y tiene soporte de hardware para operaciones atómicas . [39] Los errores de caché L2 son manejados por dos controladores de memoria DDR3 integrados que funcionan a 1,33 GHz. El chip también integra lógica para comunicaciones de chip a chip en una configuración de toro 5D, con enlaces de chip a chip de 2 GB/s. El chip Blue Gene/Q se fabrica mediante el proceso SOI de cobre de IBM a 45 nm. Ofrece un rendimiento máximo de 204,8 GFLOPS y consume aproximadamente 55 vatios. El chip mide 19×19 mm (359,5 mm²) y consta de 1,47 mil millones de transistores. Para completar el nodo de cómputo, el chip se monta en una tarjeta de cómputo junto con 16 GB de DRAM DDR3 (es decir, 1 GB para cada núcleo de procesador de usuario). [40]
Un "cajón de cómputo" Q32 [41] contiene 32 nodos de cómputo, cada uno de ellos enfriado por agua. [42]
Un "plano medio" (caja) contiene 16 cajones de cómputo Q32 para un total de 512 nodos de cómputo, interconectados eléctricamente en una configuración de toro 5D (4x4x4x4x2). Más allá del nivel del plano medio, todas las conexiones son ópticas. Los bastidores tienen dos planos medios, es decir, 32 cajones de computación, para un total de 1024 nodos de computación, 16,384 núcleos de usuario y 16 TB de RAM. [42]
Los cajones de E/S separados, ubicados en la parte superior de un rack o en un rack separado, están enfriados por aire y contienen 8 tarjetas de cómputo y 8 ranuras de expansión PCIe para redes InfiniBand o 10 Gigabit Ethernet . [42]
Actuación
En el momento del anuncio del sistema Blue Gene/Q en noviembre de 2011, un sistema inicial Blue Gene/Q de 4 racks (4096 nodos, 65536 núcleos de procesador de usuario) alcanzó el puesto 17 en la lista TOP500 [1] con 677,1 TeraFLOPS Linpack, superando la instalación original BlueGene/L de 104 bastidores de 2007 descrita anteriormente. El mismo sistema de 4 racks alcanzó la primera posición en la lista Graph500 [3] con más de 250 GTEPS (giga de bordes recorridos por segundo ). Los sistemas Blue Gene/Q también encabezaron la lista Green500 de las supercomputadoras con mayor eficiencia energética con hasta 2,1 GFLOPS/W . [2]
En junio de 2012, las instalaciones de Blue Gene/Q ocuparon las primeras posiciones en las tres listas: TOP500 , [1] Graph500 [3] y Green500 . [2]
Instalaciones
La siguiente es una lista incompleta de instalaciones de Blue Gene/Q. En junio de 2012, la lista TOP500 contenía 20 instalaciones Blue Gene/Q de 1/2 rack (512 nodos, 8192 núcleos de procesador, 86,35 TFLOPS Linpack) y más grandes. [1] Con una eficiencia energética (independiente del tamaño) de aproximadamente 2,1 GFLOPS/W, todos estos sistemas también ocuparon los primeros puestos de la lista Green 500 de junio de 2012 . [2]
Un sistema Blue Gene/Q llamado Sequoia se entregó al Laboratorio Nacional Lawrence Livermore (LLNL) a partir de 2011 y se implementó por completo en junio de 2012. Es parte del Programa de Computación y Simulación Avanzada que ejecuta simulaciones nucleares e investigación científica avanzada. Consta de 96 bastidores (que comprenden 98.304 nodos de cómputo con 1,6 millones de núcleos de procesador y 1,6 PB de memoria) que cubren un área de aproximadamente 3000 pies cuadrados (280 m 2 ). [43] En junio de 2012, el sistema fue clasificado como la supercomputadora más rápida del mundo. [44] [45] con un pico de 20,1 PFLOPS , 16,32 PFLOPS sostenidos (Linpack), consumiendo hasta 7,9 megavatios de potencia. [1] En junio de 2013, su rendimiento se cotiza en 17,17 PFLOPS sostenidos (Linpack). [1]
En 2012 se instaló un sistema Blue Gene/Q de 10 PFLOPS (pico) llamado Mira en el Laboratorio Nacional de Argonne en Argonne Leadership Computing Facility. Consta de 48 bastidores (49,152 nodos de cómputo), con 70 PB de almacenamiento en disco (470 GB/s ancho de banda de E/S). [46] [47]
JUQUEEN en el Forschungzentrum Jülich es un sistema Blue Gene/Q de 28 racks y desde junio de 2013 hasta noviembre de 2015 fue la máquina mejor clasificada en Europa en el Top500. [1]
Vulcan en el Laboratorio Nacional Lawrence Livermore (LLNL) es un sistema Blue Gene/Q de 24 racks y 5 PFLOPS (pico) que se puso en servicio en 2012 y se desmanteló en 2019. [48] Vulcan sirvió para proyectos de laboratorios industriales a través de High Performance Computing de Livermore (HPC) Centro de Innovación [49] , así como colaboraciones académicas en apoyo de las misiones del DOE/Administración Nacional de Seguridad Nuclear (NNSA). [50]
Fermi en las instalaciones de Supercomputación CINECA , Bolonia, Italia, [51] es un sistema Blue Gene/Q de 10 racks y 2 PFLOPS (pico).
Como parte de DiRAC , el EPCC alberga un sistema Blue Gene/Q de 6 racks (6144 nodos) en la Universidad de Edimburgo [52]
En 2013 se instaló en el Instituto Politécnico Rensselaer un sistema Blue Gene/Q de cinco bastidores con hardware informático adicional llamado AMOS . [53] El sistema tenía una potencia de 1048,6 teraflops, la supercomputadora más poderosa de cualquier universidad privada y la tercera supercomputadora más poderosa entre todas universidades en 2014. [54]
En junio de 2012 se instaló un sistema Blue Gene/Q de 838 TFLOPS (pico) llamado Avoca en la Victorian Life Sciences Computation Initiative . [55] Este sistema es parte de una colaboración entre IBM y VLSCI, con el objetivo de mejorar el diagnóstico, encontrar nuevos objetivos farmacológicos, perfeccionar tratamientos y mejorar nuestra comprensión de las enfermedades. [56] El sistema consta de 4 bastidores, con 350 TB de almacenamiento, 65.536 núcleos y 64 TB de RAM. [57]
En julio de 2012 se instaló un sistema Blue Gene/Q de 209 TFLOPS (pico) en la Universidad de Rochester . [58] Este sistema es parte del Centro de Ciencias de la Salud para la Innovación Computacional Archivado el 19 de octubre de 2012 en Wayback Machine , que se dedica a la aplicación de la informática de alto rendimiento a programas de investigación en ciencias de la salud . El sistema consta de un único bastidor (1024 nodos informáticos) con 400 TB de almacenamiento de alto rendimiento. [59]
En marzo de 2013 se instaló en la EPFL un sistema Blue Gene/Q de pico de 209 TFLOPS (172 TFLOPS LINPACK) llamado Lemanicus. [60] Este sistema pertenece al Centro de Ciencia de Modelado Avanzado CADMOS ( [61] ), que es una colaboración entre tres principales instituciones de investigación a orillas del lago Lemán en la parte francófona de Suiza: la Universidad de Lausana , la Universidad de Ginebra y la EPFL . El sistema consta de un único bastidor (1024 nodos de cómputo) con 2,1 PB de almacenamiento IBM GPFS-GSS.
A principios de 2011 se instaló un sistema Blue Gene/Q de medio rack, con aproximadamente 100 TFLOPS (pico), llamado Cumulus en el Centro de Recursos Computacionales A*STAR, Singapur .
Aplicaciones
Se han ejecutado aplicaciones científicas sin precedentes en el BG/Q, el primero en superar los 10 petaflops de rendimiento sostenido. El marco de simulación de cosmología HACC logró casi 14 petaflops con una prueba de referencia de 3,6 billones de partículas, [63] mientras que el código cardioide, [64] [65] que modela la electrofisiología del corazón humano, logró casi 12 petaflops con una prueba casi en tiempo real. simulación, ambos en Sequoia . Un solucionador de flujo totalmente comprimible también logró 14,4 PFLOP/s (originalmente 11 PFLOP/s) en Sequoia, el 72% del rendimiento máximo nominal de la máquina. [66]
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enlaces externos
Investigación de IBM: gen azul
Supercomputadoras de próxima generación: descripción general de Blue Gene/P (pdf)
