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Bionomía

Bionomia (anteriormente Bloodhound Tracker [1] ) es una base de datos y una herramienta de entrada de datos que permite asignar las cadenas de nombres de los recolectores y de los taxonomistas que determinan los datos de los especímenes a la persona única que recolectó o identificó el espécimen. Si la persona está viva, esto se hace a través de su identificador ORCID , y si está muerta, a través de su identificador Wikidata . De este modo, resuelve la ambigüedad cuando dos o más recolectores tienen nombres similares; o cuando un recolector ha trabajado con dos nombres, o un solo nombre escrito de dos o más formas. Los datos de especímenes asociados con Bionomia y utilizados por ella son los datos agregados de GBIF . [2]

Este mecanismo de contribución a los datos de especímenes surgió de un proyecto [3] iniciado por el Muséum national d'histoire naturelle , París (MNHN) en marzo de 2019, [4] y está motivado (en parte) por "la importancia mundial de las colecciones de historia natural, (que) están en riesgo porque están críticamente subfinanciadas o subvaloradas. Un factor que contribuye a esta aparente negligencia es la falta de un sistema de recompensa profesional que cuantifique e ilustre la amplitud y profundidad de la experiencia requerida para recolectar e identificar especímenes, mantenerlos, digitalizar sus etiquetas, movilizar los datos y mejorar estos datos a medida que las partes interesadas identifican errores y omisiones". [5] También está motivado por el hecho de que el importante trabajo de los taxónomos en la identificación de especímenes en colecciones de todo el mundo no se reconoce, y este fracaso, falla tanto a las instituciones como a los taxónomos. [6] En agosto de 2018, se lanzó Bionomia (bajo el nombre de Bloodhound Tracker) como una presentación al Desafío Ebbe Nielsen . [7]

Otros artículos que establecen el escenario, la razón de ser y el propósito de la Bionomía son: [8] [9] [10] [11]

La tarea principal de Bionomia es resolver las cadenas de nombres de los diversos coleccionistas y taxonomistas que han determinado las especies de un espécimen en seres humanos únicos. Una vez hecho esto, los registros de especímenes de plantas y animales contenidos en las descargas de GBIF (referenciados permanentemente por DOI), junto con los artículos derivados de ellos, [12] se vinculan a los perfiles de personas de Bionomia. Por lo tanto, el trabajo taxonómico fundamental para la investigación de plantas se puede rastrear hasta la institución que los posee y hasta el taxónomo, la institución de enlace, el taxónomo y la ciencia generada.

De este modo, Bionomia, al cuantificar las contribuciones de los taxónomos, permite contabilizar su trabajo, no sólo en términos de recuentos de especímenes, sino también en términos de recuentos de artículos científicos.

Contribuyendo

Para atribuir datos de recopilación/identificación en Bionomia y ver los datos de perfil de los recopiladores/identificadores, una persona debe iniciar sesión en el sitio de Bionomia a través de una identificación ORCID (preferiblemente pública).

Los perfiles de los recopiladores son privados de manera predeterminada, lo que significa que el perfil de cualquier persona viva que haya contribuido a los datos de especímenes agregados por GBIF no se puede ver hasta que el recopilador o identificador en particular haga público su perfil. Un perfil privado significa que los datos de un recopilador no son visibles ni verificables por otros. (Sin embargo, se pueden atribuir especímenes a esa persona).

Al pulsar "Ayuda Atributo" para obtener un perfil, aparecen los registros de especímenes de GBIF con cadenas que forman parte del nombre de la persona. A veces, a partir de la cadena de identificación/colector, la fecha, la institución y el país en el que se recolectó, se desprende claramente que el espécimen debe atribuirse a la persona. Sin embargo, a menudo es necesario examinar todos los datos transcritos del espécimen y también puede haber una fotografía de alta resolución razonable del espécimen en sí junto con todas sus anotaciones a lo largo de los años, lo que permite aceptar o rechazar el espécimen como si hubiera sido recolectado por la persona. Cuando se examina el espécimen, se está en la propia base de datos de GBIF y, cuando se detecta un error, es posible notificar el problema por correo electrónico al conservador de la institución que proporcionó los datos.

Ejemplos

Gente viva

Por ejemplo, el perfil de Kevin Thiele [13] en Bionomia muestra que ha determinado (identificado) unos 11.291 especímenes botánicos de al menos 12 países, ha recolectado unos 4.797 especímenes recolectados de al menos 4 países, y que 21 de estos especímenes (identificados o recolectados) se han utilizado en 10 artículos publicados, y que al 5 de junio de 2020, queda un 6% más de especímenes que pueden o no haber sido recolectados o identificados por él. Al presionar en la pestaña "Especialidades" [14] se muestra que ha recolectado 542 especímenes de Myrtaceae y 459 especímenes de Poaceae , al tiempo que ha identificado 3829 especímenes de Dilleniaceae y 2916 especímenes de Rhamnaceae . La pestaña "Depositado en" [15] revela que los especímenes que ha recolectado están distribuidos en 22 instituciones.

El perfil de Shelley James [16] muestra que ha determinado 2836 especímenes botánicos de al menos 20 países, ha recolectado 3522 de 5 países y que 4457 de los especímenes que ha identificado o recolectado se han utilizado en 33 artículos científicos, mientras que Stylianos Chatzimanolis (un sistemático de escarabajos) ha recolectado 31,493 especímenes identificados de al menos 38 países, 33,667 especímenes recolectados de al menos 15 países, de los cuales 6 se han utilizado en 3 artículos científicos. [17]

Coleccionistas anteriores

Se cree que Mary Ann McHard , una pionera de Australia Occidental que recolectó para Ferdinand von Mueller (y cuyo perfil también es público) [18] recolectó al menos 2072 especímenes existentes, y estos aún contribuyen al conocimiento científico; 12 de sus especímenes contribuyeron a un artículo científico. [19]

Hermann Beckler , [20] quien recolectó en Australia entre 1856 y 1862, tiene 3179 especímenes existentes recolectados por él, algunos supuestamente recolectados en los EE. UU. (fuente GBIF ), (lo que ilustra el poder de este proyecto/sitio web en el sentido de que los errores de transcripción e interpretación cometidos en la base de datos de especímenes pueden notarse y corregirse). Ocho de sus especímenes se han utilizado en cuatro publicaciones científicas. [21] [22] [23] [24] [25]

Referencias

  1. ^ Shorthouse, David P. (15 de junio de 2020). "A Rebrand". Bionomia.net . Consultado el 19 de junio de 2020 .
  2. ^ "Red GBIF". www.gbif.org . Consultado el 4 de junio de 2020 .
  3. ^ "DataPOC MHNH: UN OUTIL POUR EXPLORER LES RICHESSES DES DONNÉES PRODUITES PAR LA RECHERCHE EN SCIENCES NATURELLES". datapoc.mnhn.fr . Consultado el 4 de junio de 2020 .
  4. ^ Besombes, C.; Chagnoux, S.; Illien, G. (18 de junio de 2019). "Gente de las colecciones: ¿Facilitadores de la interoperabilidad?". Ciencia y estándares de información sobre biodiversidad . 3 : e35268. doi : 10.3897/biss.3.35268 . ISSN  2535-0897.
  5. ^ Shorthouse, DP "Bionomia: fundamento". bionomia.net . Consultado el 4 de junio de 2020 .
  6. ^ McDade, LA; Maddison, DR; Guralnick, R.; Piwowar, HA; Jameson, ML; Helgen, KM; Herendeen, PS; Hill, A.; Vis, ML (2011). "La biología necesita un sistema de evaluación moderno para la productividad profesional". BioScience . 61 (8): 619–625. doi : 10.1525/bio.2011.61.8.8 . ISSN  1525-3244.
  7. ^ Shorthouse, David P. "Historia". bionomia.net . Consultado el 18 de junio de 2020 .
  8. ^ Vos, R.; Biserkov, J.; Balech, B.; Beard, N.; Blissett, M.; Brenninkmeijer, C.; van Dooren, T.; Eades, D.; Gosline, G.; Groom, Q.; Hamann, T. (16 de junio de 2014). "Datos enriquecidos sobre biodiversidad como recurso y servicio". Revista de datos sobre biodiversidad . 2 (2): e1125. doi : 10.3897/BDJ.2.e1125 . ISSN  1314-2828. PMC 4092319 . PMID  25057255. 
  9. ^ Groom, Q.; Besombes, C.; Brown, J.; Chagnoux, S.; Georgiev, T.; Kearney, N.; Marcer, A.; Nicolson, N.; Page, R.; Phillips, S.; Rainer, H. (13 de junio de 2019). "Progreso en la gestión de autoridad de nombres de personas para colecciones". Ciencia y estándares de información sobre biodiversidad . 3 : e35074. doi : 10.3897/biss.3.35074 . ISSN  2535-0897.
  10. ^ Shorthouse, D.; Page, R. (8 de agosto de 2019). "Cuantificación del alcance institucional a través de la red humana en colecciones de historia natural". Ciencia y estándares de información sobre biodiversidad . 3 : e35243. doi : 10.3897/biss.3.35243 . ISSN  2535-0897.
  11. ^ Page, R. (13 de junio de 2019). «Wikidata y el grafo de conocimiento sobre la biodiversidad». Ciencia y estándares de información sobre biodiversidad . 3 : e34742. doi : 10.3897/biss.3.34742 . ISSN  2535-0897.
  12. ^ "GBIF: Recursos (Literatura)". www.gbif.org . Consultado el 8 de junio de 2020 .
  13. ^ Shorthouse, DP (5 de junio de 2020). "Kevin Thiele". bionomia.net . Consultado el 5 de junio de 2020 .
  14. ^ Shorthouse, DP (5 de junio de 2020). «Kevin Thiele: Specialties». bionomia.net . Consultado el 5 de junio de 2020 .
  15. ^ Shorthouse, DP "Kevin Thiele: depositado en". bionomia.net . Consultado el 5 de junio de 2020 .
  16. ^ Shorthouse, DP (5 de junio de 2020). "Shelley James". bionomia.net . Consultado el 5 de junio de 2020 .
  17. ^ Shorthouse, DP (5 de junio de 2020). "Stylianos Chatzimanolis". bionomia.net . Consultado el 5 de junio de 2020 .
  18. ^ Shorthouse, DP (5 de junio de 2020). "Mary Ann McHard". bionomia.net . Consultado el 5 de junio de 2020 .
  19. ^ Li, M.; He, J.; Zhao, Z.; Lyu, R.; Yao, M.; Cheng, J.; Xie, L. (9 de marzo de 2020). "El modelado predictivo de la distribución de Clematis sect. Fruticella s . str . bajo el cambio climático revela una expansión del rango durante el Último Máximo Glacial". PeerJ . 8 : e8729. doi : 10.7717/peerj.8729 . ISSN  2167-8359. PMC 7067196 . PMID  32195054. 
  20. ^ Shorthouse, DP (5 de junio de 2020). "Hermann Beckler". bionomia.net . Consultado el 5 de junio de 2020 .
  21. ^ Shorthouse, DP (5 de junio de 2020). «Hermann Beckler: citas». bionomia.net . Consultado el 5 de junio de 2020 .
  22. ^ Adhikari, S.; Burke, IC; Eigenbrode, SD (26 de mayo de 2020). Fried, G. (ed.). "Biología y manejo de la manzanilla (Anthemis cotula L.): una revisión de un invasor global emergente". Weed Research . 60 (5): 313–322. Bibcode :2020WeedR..60..313A. doi : 10.1111/wre.12426 . ISSN  0043-1737.
  23. ^ Li, M.; He, J.; Zhao, Z.; Lyu, R.; Yao, M.; Cheng, J.; Xie, L. (9 de marzo de 2020). "El modelado predictivo de la distribución de Clematis sect. Fruticella s . str . bajo el cambio climático revela una expansión del rango durante el Último Máximo Glacial". PeerJ . 8 : e8729. doi : 10.7717/peerj.8729 . ISSN  2167-8359. PMC 7067196 . PMID  32195054. 
  24. ^ Ringelberg, JJ; Zimmermann, NE; Weeks, A.; Lavin, M.; Hughes, CE (2020). Moles, A. (ed.). "Biomas como arenas evolutivas: convergencia y conservadurismo en el bioma suculento transcontinental". Ecología global y biogeografía . 29 (7): 1100–1113. Bibcode :2020GloEB..29.1100R. doi : 10.1111/geb.13089 . hdl : 20.500.11850/419357 . ISSN  1466-822X.
  25. ^ Karger, DN; Kessler, M.; Conrad, O.; Weigelt, P.; Kreft, H.; König, C.; Zimmermann, NE (2019). Grytnes, J.-A. (ed.). "Por qué las líneas de árboles son más bajas en las islas: los efectos climáticos y biogeográficos tienen la respuesta". Ecología global y biogeografía . 28 (6): 839–850. Bibcode :2019GloEB..28..839K. doi :10.1111/geb.12897. ISSN  1466-822X. S2CID  91900199.

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