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Bonnie Berger

Bonnie Anne Berger (nacida en 1964 o 1965 [6] ) es una matemática y científica informática estadounidense , que trabaja como profesora de matemáticas de la Cátedra Simons y profesora de ingeniería eléctrica y ciencias de la computación en el Instituto Tecnológico de Massachusetts . Es la jefa del grupo de Computación y Biología en el Laboratorio de Ciencias de la Computación e Inteligencia Artificial del MIT . Sus intereses de investigación son los algoritmos , la bioinformática [2] y la biología molecular computacional . [7]

Educación

Berger realizó sus estudios de pregrado en la Universidad Brandeis y obtuvo su doctorado en el MIT en 1990 bajo la supervisión de Silvio Micali . [7] [3] Como estudiante, ganó el Premio Machtey en 1989 por un artículo sobre algoritmos paralelos que publicó con su compañero de estudios John Rompel en el Simposio sobre Fundamentos de la Ciencia de la Computación . [8]

Carrera e investigación

Después de completar su doctorado, Berger permaneció en el MIT para realizar investigaciones postdoctorales , donde se convirtió en miembro de la facultad en 1992. [7] Su investigación en bioinformática se ha publicado en importantes revistas científicas revisadas por pares , incluidas Science y Journal of Algorithms . [2] [9] [10] Entre sus antiguos estudiantes de doctorado se incluyen Serafim Batzoglou , [3] Lior Pachter , [4] Mona Singh , [5] Manolis Kellis y Phil Bradley.

Berger se ha desempeñado como vicepresidente de la Sociedad Internacional de Biología Computacional (ISCB) [11] y presidente del comité directivo de RECOMB . [12]

Premios y honores

Berger fue la ganadora del Premio Margaret Oakley Dayhoff en 1997. [13] En 1998 fue oradora invitada del Congreso Internacional de Matemáticos en Berlín (pero no pudo hacer una aparición personal). [14] En 1999, Berger fue incluida en una lista de los 100 principales innovadores publicada por Technology Review . [15] En 2003, Berger se convirtió en miembro de la Association for Computing Machinery (ACM), [16] y en 2012 se convirtió en miembro electo de la American Academy of Arts and Sciences y miembro de la International Society for Computational Biology (ISCB). [17] [18] En 2016, Berger fue incluida en el colegio de miembros del American Institute for Medical and Biological Engineering (AIMBE). [19] Fue incluida en la clase de 2019 de miembros de la American Mathematical Society "por contribuciones a la biología computacional, la bioinformática, los algoritmos y por la tutoría". [20] También recibió el Doctorado Honoris Causa en la École Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL). Se desempeña como miembro general de la Sección de Matemáticas en la Asociación Estadounidense para el Avance de la Ciencia (AAAS). Recibió el premio ISCB Accomplishment by a Senior Scientist Award en 2019. [1] En 2020, impartió la conferencia AWM - SIAM Sonia Kovalevsky, [21] y, además, fue elegida miembro de la Academia Nacional de Ciencias. [22] Fue elegida miembro de la Sociedad de Matemáticas Industriales y Aplicadas , en la Clase 2022 de Becarios SIAM, "por su trabajo pionero en biología molecular computacional, incluyendo genómica comparativa y compresiva, inferencia de redes, privacidad genómica y predicción de la estructura de proteínas". [23]

Vida personal

Está casada con el profesor del MIT y director ejecutivo de Akamai Technologies, F. Thomson Leighton . [24] [25]

Referencias

  1. ^ ab Fogg, Christiana N; Shamir, Ron ; Kovats, Diane E (2019). "Bonnie Berger nombrada ganadora del premio ISCB 2019 ISCB Accomplishments by a Senior Scientist Award". Bioinformática . 8 (20): 5122–5123. doi :10.1093/bioinformatics/btz389. ISSN  1367-4803. PMC  6534070 . PMID  31164973.
  2. ^ abc Publicaciones de Bonnie Berger indexadas por Google Scholar
  3. ^ abcd Bonnie Berger en el Proyecto de Genealogía Matemática
  4. ^ ab Curriculum vitae: Lior Pachter (PDF) , marzo de 2015 , consultado el 22 de octubre de 2015
  5. ^ ab Singh, Mona (1996). Algoritmos de aprendizaje con aplicaciones a la navegación de robots y al plegamiento de proteínas (tesis doctoral). Instituto Tecnológico de Massachusetts. hdl :1721.1/40579. OCLC  680493381. Icono de acceso gratuito
  6. ^ "Bonnie Berger". MIT Technology Review . 1 de noviembre de 1999.
  7. ^ abc "Bonnie Berger - MIT Mathematics". math.mit.edu . Archivado desde el original el 10 de abril de 2019 . Consultado el 15 de enero de 2015 .
  8. ^ Fogg, CN; Shamir, R.; Kovats, DE (2020). "Bonnie Berger - Premios". Bioinformática . 36 (20): 5122–5123. doi :10.1093/bioinformatics/btz389. PMC 7755407 . PMID  33351928. 
  9. ^ Roy, S.; Ernst, J.; Kharchenko, PV; Kheradpour, P.; Negre, N.; Eaton, ML; Landolin, JM; Bristow, CA; Ma, L.; Lin, MF; Washietl, S.; Arshinoff, BI; Ay, F.; et al. (2010). "Identificación de elementos funcionales y circuitos reguladores mediante modENCODE de Drosophila". Science . 330 (6012): 1787–1797. Bibcode :2010Sci...330.1787R. doi :10.1126/science.1198374. ISSN  0036-8075. PMC 3192495 . PMID  21177974. 
  10. ^ Berger, Bonnie (1992). "Límites estrictos para el problema del subgrafo acíclico máximo". Journal of Algorithms . 25 : 1–18. doi :10.1006/jagm.1997.0864.
  11. ^ "18 de agosto de 2014 - La ISCB anuncia los resultados de las elecciones de funcionarios de 2014". ISCB . Consultado el 17 de enero de 2015 .
  12. ^ "COMITÉ DIRECTIVO DE RECOMB" . Consultado el 8 de marzo de 2019 .
  13. ^ Premio Dayhoff, Biophysical Society, consultado el 15 de enero de 2015.
  14. ^ Batzoglou, Serafim; Berger, Bonnie; Kleitman, Daniel J .; Lander, Eric ; Pachter, Lior (1998). "Desarrollos recientes en el reconocimiento computacional de genes". Doc. Math. (Bielefeld) Extra Vol. ICM Berlin, 1998, vol. I. págs. 649–658.
  15. ^ "Bonnie Berger, 34", technologyreview.com , Innovators Under 35, Technology Review , 1999, archivado desde el original el 12 de noviembre de 2018 , consultado el 15 de enero de 2015.
  16. ^ "Bonnie Berger: becaria ACM". awards.acm.org .
  17. ^ 2012 nuevos miembros Archivado el 22 de mayo de 2012 en Wayback Machine . , American Academy of Arts and Sciences , consultado el 15 de enero de 2015.
  18. ^ "Berger nombrado miembro de la ISCB - MIT CSAIL" . Consultado el 17 de enero de 2015 .
  19. ^ "Bonnie Berger será incorporada a la élite de la ingeniería médica y biológica" (PDF) . AIMBE . Consultado el 6 de marzo de 2016 .
  20. ^ Clase 2019 de los miembros de la AMS, American Mathematical Society , consultado el 7 de noviembre de 2018
  21. ^ "Conferencias de Sonia Kovalevsky".
  22. ^ "Elecciones NAS 2020". www.nasonline.org . Consultado el 17 de junio de 2020 .
  23. ^ "SIAM anuncia la clase de becarios de 2022". Noticias SIAM . 31 de marzo de 2022 . Consultado el 31 de marzo de 2022 .
  24. ^ Eisenberg, David (28 de julio de 2022). "Bonnie Berger '83 establece una cátedra junior en matemáticas con una donación de $2,5 millones". Brandeis.
  25. ^ "Un nuevo hogar para el Departamento de Matemáticas del MIT". MIT Science. 10 de junio de 2016.