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Ben Langmead

Ben Langmead es biólogo computacional y profesor asociado en el Grupo de Medicina y Biología Computacional de la Universidad Johns Hopkins . [1] [2]

Educación

Langmead obtuvo su licenciatura en ciencias de la computación de Columbia College, Universidad de Columbia en 2003. Obtuvo su maestría en ciencias y su doctorado en ciencias de la computación de la Universidad de Maryland , supervisada por Steven Salzberg , en 2009 y 2012, respectivamente. [3]

Carrera

Langmead es conocido por desarrollar el algoritmo de alineación de secuencias Bowtie , [4] que implementa la transformada de Burrows-Wheeler para mejorar la escalabilidad de la alineación de secuencias. A partir de 2022 , el artículo original de Genome Biology que describe el paquete de software Bowtie ha sido citado más de 20.000 veces.

Langmead se convirtió en profesor asistente en la Universidad Johns Hopkins en julio de 2012. [3]

Premios

Langmead recibió el premio Benjamin Franklin en 2016 por su promoción de materiales de acceso gratuito y abierto para su uso en ciencias biológicas. [5]

Referencias

  1. ^ "Benjamin Langmead - Departamento de Informática". Departamento de Ciencias de la Computación . Consultado el 23 de marzo de 2017 .
  2. ^ Publicaciones de Ben Langmead indexadas por Google Scholar
  3. ^ ab "CV de Langmead" (PDF) . Consultado el 24 de marzo de 2017 .
  4. ^ Langmead, Ben; Trapnell, Cole; Papá, Mihai; Salzberg, Steven L. (2009). "Alineamiento ultrarrápido y con memoria eficiente de secuencias cortas de ADN con el genoma humano". Biología del genoma . 10 (3): R25. doi : 10.1186/gb-2009-10-3-r25 . PMC 2690996 . PMID  19261174. 
  5. ^ "Premio Benjamin Franklin - Bioinformatics.org". www.bioinformática.org . Consultado el 23 de marzo de 2017 .

enlaces externos

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