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David Bartel

David P. Bartel es un biólogo molecular estadounidense conocido por su trabajo sobre los microARN . Bartel es profesor de biología en el Instituto Tecnológico de Massachusetts , miembro del Instituto Whitehead e investigador del Instituto Médico Howard Hughes (HHMI).

Biografía

Bartel obtuvo su licenciatura en biología en el Goshen College en 1982 y su doctorado en virología en la Universidad de Harvard en 1993, bajo la tutoría de Jack W. Szostak . [1]

Mientras estaba en el laboratorio de Szostak, Bartel aisló las primeras ribozimas directamente de una secuencia aleatoria, utilizando la evolución in vitro (entre ellas, la ligasa de clase I). [2] Después de convertirse en independiente en el Instituto Whitehead, desarrolló aún más esta ribozima para que funcionara como una ARN polimerasa dependiente de ARN para extender cebadores en plantillas de ARN externas, lo que reforzó la teoría del "mundo del ARN". [3] [4]

Más tarde, Bartel cambió el enfoque de su investigación hacia la biología de los microARN y, en particular, hacia la comprensión de sus funciones reguladoras. [5] Los microARN son fragmentos cortos de ARN, de unos 22 nucleótidos de longitud, que amortiguan la expresión génica mediante el silenciamiento de los ARN mensajeros (ARNm). Su laboratorio fue uno de los tres que descubrió que los animales tienen muchos de estos pequeños ARN reguladores, [6] [7] [8] y fue el primero en describir los microARN en plantas. [9] [10] A través de su trabajo con microARN, desarrolló una metodología que predice sus objetivos reguladores y creó la herramienta basada en la web TargetScan , que pone estas predicciones a disposición de la comunidad investigadora. [11] [12] [13] [14] [15] Su investigación también ha demostrado que la mayoría de los ARNm humanos están regulados por microARN y que los microARN actúan predominantemente para disminuir los niveles de sus objetivos de ARNm. [13] [16]

Bartel también descubrió otros tipos de ARN reguladores, incluidos los ARNi heterocromáticos, que silencian el ADN en lugar del ARN. [17] Además, Bartel está investigando las funciones de los ARN largos no codificantes (lncRNA) y cómo las regiones no traducidas y las colas de los ARNm reclutan y median los fenómenos reguladores. [5]

Bartel es fundador y asesor científico de Alnylam Pharmaceuticals, una empresa fundada en 2002 para promover “la terapia de interferencia de ARN (RNAi) como una nueva clase de medicamentos innovadores”. [18]

En 2006, Bartel ocupó el segundo lugar en la clasificación de citas de Thomson Reuters en el campo de la biología molecular y la genética. Ha recibido varios premios y fue elegido miembro de la Academia Nacional de Ciencias en 2011. [19]

Referencias

  1. ^ "David P. Bartel '82". Boletín de Goshen . 2007. Consultado el 8 de marzo de 2014 .
  2. ^ Science . 10 de septiembre de 1993;261(5127):1411-8. "Aislamiento de nuevas ribozimas a partir de un gran conjunto de secuencias aleatorias". Bartel DP, Szostak JW.
  3. ^ Trends Cell Biol. 1999 Dic;9(12):M9-M13. "Construcción de un mundo de ARN". Bartel DP, Unrau PJ.
  4. ^ Johnston, WK; Unrau, PJ; Lawrence, MS; Glasner, ME; Bartel, DP (18 de mayo de 2001). "Polimerización de ARN catalizada por ARN: extensión precisa y general de cebadores con plantilla de ARN". Science . 292 (5520): 1319–25. Bibcode :2001Sci...292.1319J. CiteSeerX 10.1.1.70.5439 . doi :10.1126/science.1060786. PMID  11358999. S2CID  14174984. 
  5. ^ ab "David Bartel". HHMI . Consultado el 7 de octubre de 2016 .
  6. ^ "Science". 26 de octubre de 2001;294(5543):853-8. "Identificación de nuevos genes que codifican ARN pequeños expresados". Lagos-Quintana M1, Rauhut R, Lendeckel W, Tuschl T.
  7. ^ "Science". 26 de octubre de 2001;294(5543):858-62. "Una clase abundante de ARN diminutos con probables funciones reguladoras en Caenorhabditis elegans". Lau NC1, Lim LP, Weinstein EG, Bartel DP.
  8. ^ "Science". 26 de octubre de 2001;294(5543):862-4. "Una clase extensa de ARN pequeños en Caenorhabditis elegans. Lee RC1, Ambros V.
  9. ^ "Genes Dev." 1 de julio de 2002;16(13):1616-26. "MicroARN en plantas". Reinhart BJ1, Weinstein EG, Rhoades MW, Bartel B, Bartel DP.
  10. ^ "Cell". 23 de agosto de 2002;110(4):513-20. "Predicción de dianas de microARN de plantas". Rhoades MW1, Reinhart BJ, Lim LP, Burge CB, Bartel B, Bartel DP.
  11. ^ "Cell". 14 de enero de 2005;120(1):15-20. "El emparejamiento de semillas conservado, a menudo flanqueado por adenosinas, indica que miles de genes humanos son objetivos de microARN". Lewis BP, Burge CB, Bartel DP.
  12. ^ "Mol Cell". 6 de julio de 2007;27(1):91-105. "Especificidad de la orientación de los microARN en mamíferos: determinantes más allá del apareamiento de semillas". Grimson A1, Farh KK, Johnston WK, Garrett-Engele P, Lim LP, Bartel DP.
  13. ^ ab "Genome Res." 2009 Ene;19(1):92-105. "La mayoría de los ARNm de mamíferos son dianas conservadas de los microARN". Friedman RC1, Farh KK, Burge CB, Bartel DP.
  14. ^ Agarwal, Vikram; Bell, George W.; Nam, Jin-Wu; Bartel, David P. (12 de agosto de 2015). "Predicción de sitios diana eficaces para microARN en ARNm de mamíferos". eLife . 4 : e05005. doi : 10.7554/eLife.05005 . ISSN  2050-084X. PMC 4532895 . PMID  26267216. 
  15. ^ Agarwal, V; Subtelny, AO; Thiru, P; Ulitsky, I; Bartel, DP (4 de octubre de 2018). "Predicción de la eficacia de la focalización de microARN en Drosophila". Genome Biology . 19 (1): 152. doi : 10.1186/s13059-018-1504-3 . PMC 6172730 . PMID  30286781. 
  16. ^ Guo, H; Ingolia, NT; Weissman, JS; Bartel, DP (12 de agosto de 2010). "Los microARN de mamíferos actúan predominantemente para disminuir los niveles de ARNm objetivo". Nature . 466 (7308): 835–40. Bibcode :2010Natur.466..835G. doi :10.1038/nature09267. PMC 2990499 . PMID  20703300. 
  17. ^ Reinhart, BJ; Bartel, DP (13 de septiembre de 2002). "Los ARN pequeños corresponden a repeticiones heterocromáticas del centrómero". Science . 297 (5588): 1831. doi :10.1126/science.1077183. PMID  12193644. S2CID  42288846.
  18. ^ "Consejo asesor científico". Alnylam.com . Consultado el 5 de octubre de 2016 .
  19. ^ "David Bartel, miembro de Whitehead, elegido miembro de la Academia Nacional de Ciencias" . Consultado el 25 de enero de 2015 .

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