Biochemical and Organic Simulation System ( BOSS ) es un programa de modelado molecular de propósito general que realiza cálculos de mecánica molecular , simulaciones de mecánica estadística Metropolis Monte Carlo y cálculos semiempíricos de mecánica cuántica Austin Model 1 (AM1), PM3 y PDDG/PM3 . [1] Los cálculos de mecánica molecular cubren minimizaciones de energía, análisis de modo normal y búsqueda conformacional con los campos de fuerza Optimized Potentials for Liquid Simulations ( OPLS ). BOSS es desarrollado por el profesor William L. Jorgensen en la Universidad de Yale y distribuido comercialmente por Cemcomco, LLC y Schrödinger , Inc.