PeptideAtlas es un recurso de datos proteómicos que reúne conjuntos de datos de espectrometría de masas en tándem de todo el mundo, los reprocesa con el Trans-Proteomic Pipeline y pone el resultado combinado a disposición de la comunidad de forma gratuita . Peptide Atlas es uno de los miembros fundadores del Consorcio ProteomeXchange.
La primera concepción de PeptideAtlas comenzó en el Instituto de Biología de Sistemas , en el laboratorio de investigación de Ruedi Aebersold, por Eric Deutsch y Sharon Chen en la Base de Datos de Péptidos Anotados (APD). El concepto se amplió aún más con los esfuerzos adicionales de Parag Mallick y Frank Desiere. La primera instancia de un conjunto de experimentos humanos se publicó en 2004 con el nombre de Human PeptideAtlas. [1]
El concepto se amplió aún más a muchas otras especies a lo largo de los años con el gran esfuerzo de Nichole King, Zhi Sun, Terry Farrah y Dave Campbell.
PeptideAtlas todavía se mantiene y desarrolla en el Instituto de Biología de Sistemas en el laboratorio de investigación de Robert Moritz, dirigido por Eric Deutsch y con importantes esfuerzos de Zhi Sun y Dave Campbell.