Antoine Danchin (nacido el 7 de mayo de 1944) es un genetista francés . Es más conocido por su investigación en varios campos de la biología, desde la estructura y función de la adenilato ciclasa , hasta el modelado del aprendizaje en el sistema nervioso y el desarrollo temprano de la genómica y la bioinformática . Es el presidente de la startup AMAbiotics que se especializa en biorremediación metabólica y biología sintética. Fue director del Departamento de Genomas y Genética del Instituto Pasteur en París, donde dirigió la Unidad de Genética de Genomas Bacterianos.
Se formó como matemático en el Instituto Henri Poincaré y como físico en la Escuela Normal Superior . Trabajando primero con Mildred Cohn , Marianne Grunberg-Manago e Ionel Solomon en resonancia magnética nuclear , Danchin se convirtió en microbiólogo experimental a principios de los años setenta. Creó con Philippe Courrège y Jean-Pierre Changeux en el Instituto de biología físico-química de París, Francia, un seminario de trabajo donde trabajaron juntos en la construcción de modelos matemáticos de aprendizaje y memoria. [2]
Interesado en la formación universitaria, creó, junto con Maurice Guéron, el primer semestre de Biología en la Escuela Politécnica y desarrolló su docencia durante cuatro años. Entre sus primeros alumnos se encuentran Daniel Kahn, Patrick Charnay y muchos otros. El objetivo principal de su investigación ha sido tratar de entender cómo los genes pueden funcionar colectivamente en la célula. Esto lo llevó a trabajar en sistemas de regulación que controlan la expresión génica global en bacterias. Parte de su trabajo se dedicó al estudio de las enzimas que sintetizan el AMP cíclico. Estableció la clasificación de referencia de las adenilato ciclasas [3] después de que su laboratorio clonara y secuenciara con éxito los genes de las toxinas de la adenilato ciclasa del agente de la tos ferina [4] así como del agente del ántrax [5] . Este trabajo lo llevó a desencadenar reflexiones éticas sobre las prácticas de la genética molecular y la genómica en una época en la que esto no se consideraba importante. [6]
Danchin inició en 1985 una colaboración con científicos informáticos para la evaluación de técnicas de inteligencia artificial para el estudio de problemas integrados en genética molecular . [7] Esto lo convenció de que era el momento de investigar los genomas como un todo, siempre que se iniciara en paralelo un esfuerzo importante en ciencias de la computación ( biología in silico ). A principios de 1987 propuso que se emprendiera un programa de secuenciación para Bacillus subtilis . Esta propuesta se actualizó mediante un esfuerzo conjunto europeo sobre este genoma, que comenzó en 1988. La secuencia completa se publicó en 1997. [8] El primer descubrimiento significativo e inesperado de este trabajo fue, en 1991, que muchos genes (en ese momento, la mitad de los genes) eran de función completamente desconocida. Esto lo llevó a intentar organizar la bioinformática en Francia con la ayuda de varios colegas en universidades, CNRS e INRIA , a través de la creación de un grupo nacional, GDR 1029 (1991-1995) y posteriormente a través de la coordinación del programa de bioinformática del Groupement de Recherche et d'Etudes des Genomes (1992-1996), luego en el Comité de Coordination des Sciences du Vivant (1998-2000). La resecuenciación y reanotación del genoma de B. subtilis se completó en 2009 para actualizar la secuencia y anotación de este genoma de referencia . [9]
En el año 2000, Danchin creó el Centro de Investigación HKU-Pasteur en Hong Kong, destinado a desarrollar la genómica microbiana en la región, con la ayuda de la Comisión de Innovación y Tecnología del gobierno de la RAE de Hong Kong para desarrollar la bioinformática (programa Biosupport). [10]
Danchin está desarrollando actualmente reflexiones teóricas y experimentos en el dominio de la biología sintética , [11] intentando hacer explícita la idea de que las células se comportan como ordenadores ( máquinas de Turing ) fabricando ordenadores. [12] Junto con Victor de Lorenzo, creó la revista de acceso abierto y gratuito Symplectic Biology , dedicada a publicar ideas innovadoras en sistemas y biología sintética. [13]
Antoine Danchin es el padre de Raphael Danchin.