Ana Margarita de Hesse-Homburg (31 de agosto de 1629 en Homburg - 3 de agosto de 1686 en Oberkotzau ), fue una landgravina de Hesse-Homburg por nacimiento y por matrimonio duquesa de Schleswig-Holstein-Sonderburg-Wiesenburg .
Ana Margarita era la única hija del Landgrave Federico I de Hesse-Homburg (1585-1638) de su matrimonio con Margarita Isabel (1604-1667), hija del Conde Cristóbal de Leiningen-Westerburg.
Se casó el 5 de mayo de 1650 en Homburg con el duque Felipe Luis de Holstein-Wiesenburg (1620-1689), quien compró el castillo de Wiesenburg y el señorío asociado en 1663.
A partir de 1659, empleó a su ahijada Johanna Eleonora von Merlau . Más tarde, Johanna Eleonora se casaría con Johann Wilhelm Petersen y formularía una forma radical de pietismo . En la corte, Johanna Eleonora conoció a Philipp Jacob Spener y a Johann Jakob Schütz y desarrolló una profunda amistad con la hija de Ana Margarita, Sophie Elisabeth.
De su matrimonio Ana Margarita tuvo los siguientes hijos: