La caja del A1000 tiene unas características que le distinguen de modelos posteriores: fue el único que incluyó el logotipo Amiga "checkmark", estaba ligeramente elevada para permitir guardar el teclado (un "garaje del teclado") y en su interior llevaba en relieve las firmas de los diseñadores del Amiga, incluido Jay Miner y la pisada de su perro Mitchy.Muchos usuarios del A1000 continuaron unidos a sus máquinas mucho después de que modelos más recientes lo dejaran obsoleto y atrajo un mercado numeroso de actualizaciones.En su lugar, el A1000 incluía una placa hija con 256KB de RAM, llamada "Writable Control Store" (WCS), en la que el sistema operativo era arrancado desde un disquete (el disco contenía la imagen de 256KB, conocida como "kickstart").El WCS estaba protegido de escrituras después de la carga, y el reinicio del sistema no requería una recarga del WCS.La primera se vendió únicamente en Canadá y Estados Unidos; tenía una pantalla NTSC y carecía del modo de vídeo EHB, el cual tenían los demás modelos de Amiga, incluso revisiones posteriores de este modelo.
Firma de Jay Miner en la parte superior de la caja de un Commodore Amiga 1000. La pisada es la de Mitch, el perro de Miner.