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Amalgavirus

Amalgaviridae es una familia de virus ARN bicatenarios . Los virus miembros infectan plantas y se transmiten verticalmente a través de semillas . [1] El nombre deriva de amalgam (mezcla, mezcla) que se refiere a los amalgavirus que poseen características tanto de los partitivirus como de los totivirus . [1] [2] Hay diez especies en la familia. [3]

Genoma

Los genomas del amalgavirus son monopartitos y tienen una longitud de aproximadamente 3,5 kilobases . [2] [4] Tienen dos marcos de lectura abiertos parcialmente superpuestos que codifican la ARN polimerasa dependiente de ARN (RdRp) y una posible proteína de la cápside . [2] [5]

Evolución

Se ha sugerido que los amalgavirus han evolucionado a través de la recombinación entre virus con genomas de ARN de doble cadena y de cadena negativa. [6] El análisis filogenético indica que la RdRp del amalgavirus forma un clado hermano de la proteína RdRp correspondiente de los partitivirus ( Partitiviridae ) que tienen genomas de dsRNA segmentados (bipartitos) e infectan plantas, hongos y protistas. [1] [2] [4] [6] Por el contrario, la proteína putativa de la cápside de los amalgavirus es homóloga a las proteínas de la nucleocápside de los virus de ARN de cadena negativa de los géneros Phlebovirus ( Bunyaviridae ) y Tenuivirus . [6]

Taxonomía

La familia Amalgaviridae tiene dos géneros y diez especies: [3]

Amalgavirus

Zibavirus

Referencias

  1. ^ abcd Martin, RR; Zhou, J; Tzanetakis, IE (2011). "Virus latente del arándano: una amalgama de Partitiviridae y Totiviridae". Virus Research . 155 (1): 175–80. doi :10.1016/j.virusres.2010.09.020. PMID  20888379.
  2. ^ abcde Sabanadzovic, S; Valverde, RA; Marrón, JK; Martín, RR; Tzanetakis, IE (2009). "Virus del tomate del sur: el vínculo entre las familias Totiviridae y Partitiviridae". Investigación de virus . 140 (1–2): 130–7. doi :10.1016/j.virusres.2008.11.018. PMID  19118586.
  3. ^ ab "Taxonomía". Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV) . Consultado el 21 de marzo de 2020 .
  4. ^ abc Sabanadzovic, S; Abou Ghanem-Sabanadzovic, N; Valverde, RA (2010). "Un nuevo virus dsRNA monopartito de rododendro". Archivos de Virología . 155 (11): 1859–63. doi :10.1007/s00705-010-0770-5. PMID  20721591. S2CID  13303861.
  5. ^ ab Liu, W; Chen, J (2009). "Un ARN bicatenario como genoma de un virus potencial que infecta a Vicia faba". Virus Genes . 39 (1): 126–31. doi :10.1007/s11262-009-0362-1. PMID  19472044. S2CID  10806942.
  6. ^ abc Krupovic M, Dolja VV, Koonin EV (2015). "Los virus de plantas de la familia Amalgaviridae evolucionaron a través de la recombinación entre virus con genomas de ARN de doble cadena y de cadena negativa". Biol Direct . 10 (1): 12. doi : 10.1186/s13062-015-0047-8 . PMC 4377212 . PMID  25886840.