La Alpha Ethniki 1959-60 fue la 24.ª temporada de la máxima división de fútbol de Grecia y la primera temporada de la liga nacional después de que la liga sustituyera al Campeonato Panhelénico . La temporada comenzó el 25 de octubre de 1959 y finalizó el 31 de julio de 1960 con los partidos de desempate. El Panathinaikos ganó su cuarto título griego y el primero en siete años.
Los 16 equipos que formaron el primer campeonato nacional quedaron de la siguiente manera:
El sistema de puntos fue: Victoria: 3 puntos - Empate: 2 puntos - Derrota: 1 punto .
Inicialmente, se suponía que la primera división contaría con 18 equipos, pero el retraso de seis semanas en el inicio del evento debido a las negociaciones financieras entre las partes involucradas (Secretaría General de Deportes, OPAP , HFF y en algunos lugares FCAs) atrasó su finalización. La HFF tomó la decisión de reducir el número de equipos a 16 y, como consecuencia, se formó una ronda de play-off de promoción para decidir los dos últimos lugares del campeonato.
El Olympiacos Chalkida se clasifica para los play-offs de ascenso.