El Acuerdo de Lagos fue un acuerdo de paz firmado el 21 de agosto de 1979 por representantes de once facciones beligerantes de la Guerra Civil de Chad , después de una conferencia en Lagos , Nigeria . El acuerdo estableció los procedimientos para establecer el Gobierno de Transición de Unidad Nacional (GUNT), que asumió el cargo en noviembre de 1979. De mutuo acuerdo, Goukouni Oueddei fue nombrado presidente, Wadel Abdelkader Kamougué fue designado vicepresidente y Hissène Habré fue nombrado ministro de Defensa Nacional, Veteranos y Víctimas de Guerra. La distribución de los puestos del gabinete se equilibró entre el sur (once carteras), el norte, el centro y el este (trece), y entre los protegidos de los estados vecinos.
Una misión de paz de la Organización de la Unidad Africana (OUA), integrada por tropas de la República del Congo , Guinea y Benín , debía sustituir a la francesa . Esta fuerza nunca se materializó en ningún sentido efectivo.
Los participantes del GUNT desconfiaban profundamente entre sí y nunca llegaron a tener un sentido de coherencia. Como resultado, las distintas milicias de las facciones permanecieron armadas. En enero de 1980, una unidad del ejército de Habré atacó a las fuerzas de uno de los grupos integrantes del GUNT en la prefectura de Ouaddaï , y el conflicto chadiano pronto alcanzó nuevos niveles de intensidad con una destrucción generalizada de vidas y bienes.