El lago Aberdeen es un lago grande de forma irregular en la región de Kivalliq , Nunavut , Canadá. Se encuentra en el Escudo Canadiense . El lago mide casi 90 km (56 mi) de este a oeste con una península en el centro que lo separa en casi dos mitades que se extienden casi 30 km (19 mi) de norte a sur. El Santuario de Vida Silvestre Thelon está al oeste.
El río Thelon es el principal afluente y desembocadura del lago. El lago Beverly y el lago Schultz se encuentran cerca.