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ARN 6C

El ARN 6C es una clase de ARN no codificante presente en los actinomicetos . El ARN 6C se descubrió originalmente como una estructura de ARN conservada que tenía dos bucles de tallo, cada uno de los cuales contenía seis o más residuos de citosina (C). [1] Trabajos posteriores revelaron que los ARN 6C en Streptomyces coelicolor y Streptomyces avermitilis han predicho terminadores de transcripción independientes de rho , y los experimentos de PCR con microarrays y transcriptasa inversa indican que la versión de S. coelicolor se transcribe como ARN. [2] [3] La transcripción del ARN de S. coelicolor aumenta durante la esporulación y se detectaron tres transcripciones que se superponen al motivo 6C, pero que aparentemente tienen diferentes sitios de inicio y finalización. [3]

Trabajos adicionales establecieron que los ARN 6C regulan una variedad de genes codificadores de proteínas actuando como ARN antisentido de acción trans . [4] Entre los genes regulados por los ARN 6C, muchos están involucrados en la replicación del ADN y la exportación de proteínas. [4] Las bacterias de otros filos estudiados, como Pseudomonadota y Bacillota, utilizan proteínas como Hfq que facilitan las interacciones de ARN antisentido, pero los ARN 6C no parecen depender de homólogos de Hfq u otras proteínas. [4] Esta falta de dependencia de proteínas podría ser típica de las bacterias grampositivas cuyos genomas tienen un alto contenido de GC , [4] de los cuales los actinomicetos son un ejemplo destacado.

Referencias

  1. ^ Weinberg Z, Barrick JE, Yao Z y col. (2007). "Identificación de 22 ARN estructurados candidatos en bacterias utilizando el proceso de genómica comparativa CMfinder". Ácidos nucleicos Res . 35 (14): 4809–4819. doi : 10.1093/nar/gkm487. PMC  1950547 . PMID  17621584.
  2. ^ Pánek J, Bobek J, Mikulík K, Basler M, Vohradský J (2008). "Predicción biocomputacional de pequeños ARN no codificantes en Streptomyces". Genómica BMC . 9 : 217. doi : 10.1186/1471-2164-9-217 . PMC 2422843 . PMID  18477385. 
  3. ^ ab Swiercz JP, Hindra; Bobek J; et al. (noviembre de 2008). "Pequeños ARN no codificantes en Streptomyces coelicolor". Ácidos nucleicos Res . 36 (22): 7240–7251. doi : 10.1093/nar/gkn898. PMC 2602773 . PMID  19008244. 
  4. ^ abcd Mai J, Rao C, Watt J, Sun X, Lin C, Zhang L, Liu J (marzo de 2019). "El ARNs de Mycobacterium tuberculosis 6C se une a múltiples objetivos de ARNm a través de bucles ricos en C independientes de las chaperonas de ARN". Ácidos nucleicos Res . 47 (8): 4292–4307. doi :10.1093/nar/gkz149. PMC 6486639 . PMID  30820540. 

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