Actl6a

Gen codificador de proteínas en la especie Homo sapiens

La proteína similar a actina 6A es una proteína que en los humanos está codificada por el gen ACTL6A . ^{[5] [6] [7]}

Función

Este gen codifica un miembro de la familia de proteínas relacionadas con la actina (ARP), que comparten una identidad significativa de secuencia de aminoácidos con las actinas convencionales. Tanto las actinas como las ARP tienen un pliegue de actina, que es una hendidura de unión de ATP, como característica común. Las ARP están involucradas en diversos procesos celulares, incluido el transporte vesicular, la orientación del huso, la migración nuclear y la remodelación de la cromatina . Este gen codifica una proteína de subunidad de 53 kDa del complejo BAF (BRG1/brm-associated factor) en mamíferos, que está funcionalmente relacionada con el complejo SWI/SNF en S. cerevisiae y Drosophila ; se cree que este último facilita la activación transcripcional de genes específicos al antagonizar la represión transcripcional mediada por la cromatina . Junto con la beta-actina, es necesaria para la actividad máxima de ATPasa de BRG1 y para la asociación del complejo BAF con la cromatina/matriz. Se han descrito tres variantes de transcripción que codifican dos isoformas proteicas diferentes. ^[7]

Importancia clínica

El ACTL6A se amplifica en los cánceres de cabeza y de células escamosas y confiere un mal pronóstico a los pacientes. Este es también el primer informe de amplificación de un factor epigenético por Saladi SV. ^[8] En los carcinomas hepatocelulares, promueve la metástasis. ^[9]

Interacciones

Se ha demostrado que ACTL6A interactúa con SMARCA2 , ^{[10] [11] [12]} Myc , ^[11] proteína asociada al dominio de transformación/transcripción , ^[11] RuvB-like 1 ^[11] y SMARCA4 . ^{[5] [10]}

Referencias

1. GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000136518 – Ensembl , mayo de 2017
2. GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000027671 – Ensembl , mayo de 2017
3. "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
4. "Referencia PubMed de ratón:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . .
5. Zhao K, Wang W, Rando OJ, Xue Y, Swiderek K, Kuo A, Crabtree GR (diciembre de 1998). "Unión rápida y dependiente de fosfoinositol del complejo BAF tipo SWI/SNF a la cromatina después de la señalización del receptor de linfocitos T". Cell . 95 (5): 625–36. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81633-5 . PMID  9845365. S2CID  3184211.
6. Harata M, Mochizuki R, Mizuno S (julio de 1999). "Dos isoformas de una proteína humana relacionada con la actina muestran localización nuclear y expresión mutuamente selectiva entre el cerebro y otros tejidos". Biosci Biotechnol Biochem . 63 (5): 917–23. doi : 10.1271/bbb.63.917 . PMID  10380635.
7. "Gen Entrez: ACTL6A actina-like 6A".
8. Saladi SV, Ross K, Karaayvaz M, Tata PR, Mou H, Rajagopal J, Ramaswamy S, Ellisen LW (2017). "ACTL6A se coamplifica con p63 en el carcinoma de células escamosas para impulsar la activación de YAP, la proliferación regenerativa y el mal pronóstico". Cancer Cell . 31 (1): 35–49. doi :10.1016/j.ccell.2016.12.001. PMC 5225026 . PMID  28041841. 
9. Xiao S, Chang RM, Yang MY, Lei X, Liu X, Gao WB, Xiao JL, Yang LY (2016). "La 6A similar a la actina predice un mal pronóstico del carcinoma hepatocelular y promueve la metástasis y la transición epitelial-mesenquimal". Hepatología . 63 (4): 1256–71. doi :10.1002/hep.28417. PMC 4834727 . PMID  26698646. 
10. Wang W, Côté J, Xue Y, Zhou S, Khavari PA, Biggar SR, Muchardt C, Kalpana GV, Goff SP, Yaniv M, Workman JL, Crabtree GR (octubre de 1996). "Purificación y heterogeneidad bioquímica del complejo SWI-SNF de mamíferos". EMBO J. 15 (19): 5370–82. doi :10.1002/j.1460-2075.1996.tb00921.x. PMC 452280 . PMID  8895581. 
11. Park J, Wood MA, Cole MD (marzo de 2002). "BAF53 forma complejos nucleares distintos y funciona como un cofactor nuclear crítico que interactúa con c-Myc para la transformación oncogénica". Mol. Cell. Biol . 22 (5): 1307–16. doi :10.1128/MCB.22.5.1307-1316.2002. PMC 134713. PMID  11839798 . 
12. Kuroda Y, Oma Y, Nishimori K, Ohta T, Harata M (noviembre de 2002). "Expresión específica del cerebro de la proteína nuclear relacionada con la actina ArpNalpha y su participación en el complejo de remodelación de la cromatina SWI/SNF en mamíferos". Biochem. Biophys. Res. Commun . 299 (2): 328–34. doi :10.1016/S0006-291X(02)02637-2. PMID  12437990.

Lectura adicional

• Schafer DA, Schroer TA (2000). "Proteínas relacionadas con la actina". Annu. Rev. Cell Dev. Biol . 15 : 341–63. doi :10.1146/annurev.cellbio.15.1.341. PMID  10611965.
• Doyon Y, Côté J (2004). "El complejo NuA4 HAT altamente conservado y multifuncional". Curr. Opin. Genet. Dev . 14 (2): 147–54. doi :10.1016/j.gde.2004.02.009. PMID  15196461.
• Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-capping: un método simple para reemplazar la estructura de capuchón de los ARNm eucariotas con oligorribonucleótidos". Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "Construcción y caracterización de una biblioteca de ADNc enriquecida en longitud completa y enriquecida en el extremo 5'". Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID  9373149.
• Cho H, Orphanides G, Sun X, Yang XJ, Ogryzko V, Lees E, Nakatani Y, Reinberg D (1998). "Un complejo de ARN polimerasa II humano que contiene factores que modifican la estructura de la cromatina". Mol. Cell. Biol . 18 (9): 5355–63. doi :10.1128/MCB.18.9.5355. PMC  109120. PMID  9710619 .
• Phelan ML, Sif S, Narlikar GJ, Kingston RE (1999). "Reconstitución de un complejo de remodelación de cromatina central a partir de subunidades SWI/SNF". Mol. Cell . 3 (2): 247–53. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80315-9 . PMID  10078207.
• Ikura T, Ogryzko VV, Grigoriev M, Groisman R, Wang J, Horikoshi M, Scully R, Qin J, Nakatani Y (2000). "Implicación del complejo histona acetilasa TIP60 en la reparación del ADN y la apoptosis". Celúla . 102 (4): 463–73. doi : 10.1016/S0092-8674(00)00051-9 . PMID  10966108. S2CID  18047169.
• Xue Y, Canman JC, Lee CS, Nie Z, Yang D, Moreno GT, Young MK, Salmon ED, Wang W (2001). "El complejo de remodelación de cromatina SWI/SNF-B humano está relacionado con la rsc de levadura y se localiza en los cinetocoros de los cromosomas mitóticos". Proc. Natl. Sci. EE. UU . . 97 (24): 13015–20. Bibcode :2000PNAS...9713015X. doi : 10.1073/pnas.240208597 . PMC  27170 . PMID  11078522.
• Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (2001). "Hacia un catálogo de genes y proteínas humanos: secuenciación y análisis de 500 nuevos ADNc humanos que codifican proteínas completas". Res del genoma . 11 (3): 422–35. doi :10.1101/gr.GR1547R. PMC  311072 . PMID  11230166.
• Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (2001). "Localización subcelular sistemática de nuevas proteínas identificadas mediante secuenciación de ADNc a gran escala". EMBO Rep . 1 (3): 287–92. doi :10.1093/embo-reports/kvd058. PMC  1083732 . PMID  11256614.
• Sung YH, Choi EY, Kwon H (2001). "Identificación de una proteína nuclear ArpN como componente del complejo SWI/SNF humano y su asociación selectiva con un subconjunto de genes activos". Mol. Cells . 11 (1): 75–81. doi : 10.1016/S1016-8478(23)17006-3 . PMID  11266125.
• Lai CH, Chiu JY, Lin W (2001). "Identificación del gen del cuello torcido humano mediante identificación genética comparativa". Biochim. Biophys. Acta . 1517 (3): 449–54. doi :10.1016/s0167-4781(00)00295-5. PMID  11342225.
• Fuchs M, Gerber J, Drapkin R, Sif S, Ikura T, Ogryzko V, Lane WS, Nakatani Y, Livingston DM (2001). "El complejo p400 es un objetivo esencial de transformación de E1A". Cell . 106 (3): 297–307. doi : 10.1016/S0092-8674(01)00450-0 . PMID  11509179. S2CID  15634637.
• Kato H, Tjernberg A, Zhang W, Krutchinsky AN, An W, Takeuchi T, Ohtsuki Y, Sugano S, de Bruijn DR, Chait BT, Roeder RG (2002). "SYT se asocia con complejos SNF/SWI humanos y la región C-terminal de su socio de fusión SSX1 se dirige a las histonas". J. Biol. química . 277 (7): 5498–505. doi : 10.1074/jbc.M108702200 . hdl : 2066/170683 . PMID  11734557.
• Park J, Wood MA, Cole MD (2002). "BAF53 forma complejos nucleares distintos y funciona como un cofactor nuclear crítico que interactúa con c-Myc para la transformación oncogénica". Mol. Cell. Biol . 22 (5): 1307–16. doi :10.1128/MCB.22.5.1307-1316.2002. PMC  134713. PMID  11839798 .
• Ohfuchi E, Nishimori K, Harata M (2003). "Productos de empalme alternativo del gen de una proteína humana relacionada con la actina nuclear, hArpNbeta/Baf53, que codifican una isoforma proteica, hArpNbetaS, en el citoplasma". Biosci. Biotechnol. Biochem . 66 (8): 1740–3. doi : 10.1271/bbb.66.1740 . PMID:  12353638. S2CID  : 35246242.
• Kuroda Y, Oma Y, Nishimori K, Ohta T, Harata M (2003). "Expresión específica del cerebro de la proteína nuclear relacionada con la actina ArpNalpha y su participación en el complejo de remodelación de la cromatina SWI/SNF en mamíferos". Biochem. Biophys. Res. Commun . 299 (2): 328–34. doi :10.1016/S0006-291X(02)02637-2. PMID  12437990.