La Liga Premier de Malta 2003-04 (conocida como la Liga Premier MIA [1] por razones de patrocinio) fue la 24.ª temporada de la Liga Premier de Malta y la 89.ª temporada del fútbol de primera división en Malta. La liga comenzó el 22 de agosto de 2003 y terminó el 9 de mayo de 2004. Sliema Wanderers defendió con éxito el triunfo de la temporada pasada, igualando el récord de títulos de liga de Floriana de 25 campeonatos.
Los siguientes equipos ascendieron desde la Primera División al inicio de la temporada:
De la temporada anterior de la Premier League, los siguientes equipos descendieron a la Primera División:
Los equipos que ocuparon las seis primeras posiciones de la clasificación se clasificaron para el Top Six, y los puntos obtenidos durante la primera fase se redujeron a la mitad (y se redondearon hacia arriba) antes del inicio de la segunda fase. Como resultado, los equipos comenzaron con los siguientes puntos antes de la segunda fase: Sliema Wanderers 21 puntos, Birkirkara 18, Hibernians 17, Marsaxlokk 16, Floriana y Pietà Hotspurs 14.
Los equipos que terminaron en las últimas cuatro posiciones de la liga pasaron a la fase de play-out y al final de la fase los dos equipos peor ubicados descendieron a la Primera División. Los puntos obtenidos durante la primera fase se redujeron a la mitad (y se redondearon hacia arriba) antes del inicio de la segunda fase. Como resultado, los equipos comenzaron con los siguientes puntos antes de la segunda fase: Valletta 12 puntos, Balzan Youths 9, Msida Saint-Joseph 5 y Ħamrun Spartans 2.
