La lambda-carragenasa ( EC 3.2.1.162, endo-beta-1,4-carragenosa 2,6,2'-trisulfato-hidrolasa) es una enzima que descompone un polisacárido presente en las algas rojas , la lambda-carragenina . Esta enzima solo se ha encontrado en bacterias marinas . [1] [2]
Se han encontrado dos bacterias que producen lambda-carragenasa: la bacteria marina Pseudoalteromonas carrageenovora (también conocida como Alteromonas carrageenovora), cepa ATCC 43555, que se aisló del agua de mar en Nueva Escocia , y la bacteria de aguas profundas Pseudoalteromonas sp. CL19, que se aisló de una muestra de sedimento de la bahía de Suruga , Japón . [1] [2] [3]
Tanto en Alteromonas carrageenovora como en Pseudoalteromonas sp. CL19, la lambda-carragenasa está codificada por el gen cglA . El producto de este gen es una proteína que consta de 942 aminoácidos , esta proteína incluye un péptido señal de 25 aminoácidos . [1] [2] La lambda-carragenasa se encuentra como un monómero . Su pH óptimo para la actividad es 7,0 y la temperatura óptima es 35 °C. La enzima hidroliza específicamente la lambda-carragenina y no es activa contra las iota- y kappa-carrageninas, la agarosa o el porfirano . [1]
La lambda-carragenasa escinde los enlaces glucosídicos beta 1-4 en la cadena lineal de la lambda-carragenina. Esto da como resultado la formación de un tetrasacárido : alfa-D-Galp2,6S(2)-(1->3)-beta-D-Galp2S-(1->4)-alfa-D-Galp2,6S(2)-(1->3)-D-Galp2S. Esta enzima actúa a través de un único mecanismo de desplazamiento, lo que provoca una inversión de la configuración anomérica del sustrato . [1] [2]