El índice de perfil analítico , o API , es un sistema de clasificación de bacterias basado en pruebas bioquímicas. El sistema fue desarrollado para acelerar la velocidad de identificación de bacterias clínicamente relevantes . Solo se puede utilizar para identificar especies conocidas a partir de un índice. [1] Los datos obtenidos son rasgos fenotípicos . Los métodos basados en secuencias de ADN , incluida la tipificación de secuencias de múltiples locus e incluso la secuenciación del genoma completo , se utilizan cada vez más en la identificación de especies y cepas bacterianas. Estos métodos más nuevos se pueden utilizar para complementar o incluso reemplazar el uso de pruebas API en entornos clínicos.
El índice de perfil analítico (API) fue inventado en la década de 1970 en los Estados Unidos por Pierre Janin de Analytab Products Inc. [2] El sistema de prueba API es fabricado actualmente por bioMérieux . [3] La gama API introdujo una versión estandarizada y miniaturizada de técnicas existentes, que se consideraban complicadas de realizar y difíciles de leer.
La identificación sólo es posible con un cultivo microbiológico . Las tiras de prueba API consisten en pocillos que contienen sustratos deshidratados como los sustratos redox, sustratos electrogénicos y sustratos luminogénicos para detectar la actividad enzimática , generalmente relacionada con la fermentación de carbohidratos o el catabolismo de proteínas o aminoácidos por los organismos inoculados. Se utiliza una suspensión bacteriana para rehidratar cada uno de los pocillos y se incuban las tiras. Durante la incubación, el metabolismo produce cambios de color que son espontáneos o revelados por la adición de reactivos. Por ejemplo, cuando se fermentan los carbohidratos, el pH dentro del pocillo disminuye y eso se indica mediante un cambio en el color del indicador de pH. Todos los resultados de la prueba se compilan para obtener un número de perfil, que luego se compara con los números de perfil en un libro de códigos comercial (o en línea) para determinar la identificación de la especie bacteriana. [4]
Antes de comenzar una prueba, uno debe confirmar que las bacterias cultivadas son Enterobacteriaceae, esto se hace mediante una prueba rápida de oxidasa para citocromo coxidasa . Las Enterobacteriaceae son típicamente oxidasa negativas, lo que significa que no usan oxígeno como aceptor de electrones en la cadena de transporte de electrones , o usan una enzima citocromo diferente para transferir electrones al oxígeno. [5] Si se determina que el cultivo es oxidasa positivo, se deben realizar pruebas alternativas para identificar correctamente las especies bacterianas. API-20E es específico para diferenciar entre miembros de la familia de bacterias Gram-negativas Enterobacteriaceae . [6] [7] Otro sistema API, API-Staph, es específico para bacterias Gram-positivas , incluyendo especies de Staphylococcus , especies de Micrococcus y organismos relacionados. [7]
El sistema API 20E/NE es un sistema de prueba bioquímica ampliamente utilizado, diseñado para la identificación rápida de bacterias gramnegativas. Se dirige específicamente a dos grupos: enterobacterias (API 20E) y no enterobacterias (API 20NE). Este sistema es particularmente útil en microbiología clínica y estudios ambientales para identificar bacterias en función de sus actividades bioquímicas.