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Cloruro de dansilo

El cloruro de dansilo o cloruro de 5-(dimetilamino)naftaleno-1-sulfonilo es un reactivo que reacciona con grupos amino primarios en aminas alifáticas y aromáticas para producir aductos de sulfonamida fluorescentes estables de color azul o verde azulado . También se puede hacer reaccionar con aminas secundarias. El cloruro de dansilo se usa ampliamente para modificar aminoácidos; específicamente, secuenciación de proteínas y análisis de aminoácidos . [2] [3] El cloruro de dansilo también puede denominarse DNSC . Asimismo, un derivado similar, la dansilamida , se conoce como DNSA.

Además, estos conjugados proteína-DNSC son sensibles a su entorno inmediato. Esto, en combinación con su capacidad de aceptar energía (como en la transferencia de energía por resonancia de fluorescencia ) del aminoácido triptófano , permite que esta técnica de marcaje se utilice para investigar el plegamiento y la dinámica de las proteínas.

La fluorescencia de estos aductos de sulfonamida se puede mejorar añadiendo alfa-ciclodextrina . [4] El cloruro de dansilo es inestable en dimetilsulfóxido , que nunca debe utilizarse para preparar soluciones del reactivo. [5]

El coeficiente de extinción de los derivados de dansilo es importante para medir su concentración en solución. El cloruro de dansilo es uno de los derivados de sulfonamida más simples, por lo que comúnmente sirve como reactivo de partida para la producción de otros derivados. Los derivados exóticos pueden tener coeficientes de extinción muy diferentes, pero otros, como la dansilamida , son similares al cloruro de dansilo en cuanto a características de absorción y fluorescencia. Pero incluso para el cloruro de dansilo, se han informado diversos valores de coeficiente de extinción. Algunos de los valores se utilizan para estimar el grado de éxito en los intentos de conjugar el colorante con una proteína. Se pueden utilizar otros valores para determinar una concentración precisa de una solución madre. Consulte la tabla a continuación para conocer los valores específicos y sus usos.

En todos los estudios que se describen a continuación, el valor de absorción se toma siempre en el máximo que aparece entre 310 nm y 350 nm. El pico es amplio, por lo que la medición no es muy sensible a la calibración incorrecta de la longitud de onda del espectrofotómetro, y el error debido a la calibración incorrecta se puede evitar tomando el valor en el máximo en lugar de usar estrictamente 330 nm.

Preparación

Este compuesto se puede preparar haciendo reaccionar el ácido sulfónico correspondiente con un exceso de oxicloruro de fósforo (POCl 3 ) a temperatura ambiente. [10]

Referencias

  1. ^ "MSDS". Sigma-Aldrich . Archivado desde el original el 27 de diciembre de 2007. Consultado el 2 de diciembre de 2007 .
  2. ^ Walker JM (1994). "El método Dansyl para identificar aminoácidos N-terminales". Protocolos básicos de proteínas y péptidos . Métodos Mol. Biol. Vol. 32. págs. 321–8. doi :10.1385/0-89603-268-X:321. ISBN 0-89603-268-X. Número de identificación personal  7951732.
  3. ^ Walker JM (1994). "El método Dansyl-Edman para la secuenciación de péptidos". Protocolos básicos de proteínas y péptidos . Methods Mol. Biol. Vol. 32. págs. 329–34. doi :10.1385/0-89603-268-X:329. ISBN 0-89603-268-X. Número de identificación personal  7951733.
  4. ^ Kinoshita T, Iinuma F, Tsuji A (1974). "Microanálisis de proteínas y péptidos. I. Aumento de la intensidad de fluorescencia de los aminoácidos dansílicos y las proteínas dansílicas en medios acuosos y su aplicación al análisis de aminoácidos y proteínas". Química. Farmacia. Bull . 22 (10): 2413–20. doi : 10.1248/cpb.22.2413 . PMID  4468087.
  5. ^ Boyle, RE (1966). "La reacción de dimetilsulfóxido y cloruro de 5-dimetilaminonaftaleno-1-sulfonilo". The Journal of Organic Chemistry . 31 (11): 3880–3882. doi :10.1021/jo01349a529.
  6. ^ Hartley, BS; V Massey (1956). "El centro activo de la quimotripsina: 1. Marcaje con un colorante fluorescente". Biochimica et Biophysica Acta . 21 (1): 58–70. doi :10.1016/0006-3002(56)90093-2. PMID  13363860.
  7. ^ Chen, RF (1968). "Proteínas marcadas con dansilo". Analytical Biochemistry . 25 (1): 412–416. doi :10.1016/0003-2697(68)90116-4. PMID  5704757.
  8. ^ ab Weber, G (1952). "Fluorescencia polarizada de conjugados proteicos". Revista bioquímica . 51 (2): 145–155. doi :10.1042/bj0510145. PMC 1197814 . PMID  14944566. 
  9. ^ "Molecular Probes Handbook: Coumarins, Pyrenes and Other Ultraviolet Light–Excitable Fluorophores (Section 1.7)" (Manual de sondas moleculares: cumarinas, pirenos y otros fluoróforos excitables por luz ultravioleta (sección 1.7)) . Consultado el 12 de junio de 2009 .
  10. ^ Arthur Mendel (1970). "Preparación mejorada de cloruro de 5-dimetilamino-1-naftalenosulfonilo". J. Chem. Eng. Data . 15 (2): 340–341. doi :10.1021/je60045a010.