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Semiotivirus

Semotivirus es el único género de virus de la familia Belpaoviridae (anteriormente incluida en la familia Metaviridae ). [1] Las especies existen como retrotransposones en el genoma de un huésped eucariota . Los transposones BEL/pao solo se encuentran en animales. Semotivirus es el único género reconocido actualmente, la descripción del género corresponde a la descripción de la familia Belpaoviridae. [2]

Clasificación

El único género de la familia, Semotivirus, anteriormente estaba incluido en la familia Metaviridae, pero fue eliminado debido a su relación parafilética con otros géneros Metaviridae. Hay una buena posibilidad de que se agreguen más especies y géneros a la familia Belpaoviridae en el futuro, dada la diversidad de belpaoviridos que ya se reconoce. El orden del dominio Pol de las familias Belpaoviridae, Metaviridae y Retroviridae es el mismo dentro del orden Ortervirales , sin embargo, la integrasa falta en el caso de Caulimoviridae o está ubicada aguas arriba del dominio de la proteasa en el caso de Pseudoviridae . [3]

El género está formado por retrotransposones de repetición terminal larga (LTR), también conocidos como virus de transcriptasa inversa que infectan metazoos. [4]

Composición

La disposición genómica de los miembros de la familia Belpaoviridae es similar a la de los retrotransposones de repetición terminal larga (LTR) de la familia Metaviridae. [5] El genoma completo tiene 4,2–10 kb, y uno a tres genes (pol, env y gag) están flanqueados por LTR de 0,2–1,2 kb. [6] Una región no codificante que representa el segmento inicial del genoma transcrito de forma inversa se encuentra aguas abajo del 5′-LTR. A esto le sigue un sitio de unión del cebador de 18 nt que es complementario a una determinada zona dentro del extremo 3′ de un ARNt Arg o un ARNt Gly del huésped .

La síntesis de la cadena de ADN proviral se inicia con un tracto de polipurina de aproximadamente 10 nt ubicado aguas arriba de la 3'-LTR. Las poliproteínas Gag y Pol pueden estar codificadas por un gen continuo o por dos genes superpuestos. [7] Estos genes codifican los dominios de la cápside y la nucleocápside, así como los dominios de la proteasa, la transcriptasa inversa (RT), la ribonucleasa H y la integrasa.

Replicación

Se conoce poca información sobre la morfología del virión de los belpaoviridos. La morfología del virión de los semotivirus es poco conocida. Sin embargo, lo más probable es que los belpaoviridos se repliquen formando partículas similares a virus (VLP), al igual que los retroviridos, metaviridos y pseudoviridos, ya que codifican una poliproteína Gag con dominios proteicos de cápside y nucleocápside homólogos a los de otros miembros del orden Ortervirales. [8] [9] Un gen similar a env está presente en ciertos belpaoviridos, sin embargo, su papel exacto aún se desconoce. [10]

Aunque los detalles de la replicación no son bien conocidos, se cree que se asemeja a la de los miembros de la familia Metaviridae, [11] en la que la RT media la conversión de una transcripción completa en un dsADN que se incorpora al genoma del huésped por la proteína integrasa. Después de que el provirus integrado ha sido transcrito por la ARN polimerasa II del huésped, se crean nuevos ARN virales, que las enzimas del huésped correspondientes tapan y poliadenilan. Una vez en el citoplasma de la célula huésped , estos ARN virales nuevos son traducidos en VLP inmaduras por Gag y Pol. La maduración de VLP es el resultado final del procesamiento proteolítico de las poliproteínas por parte de la proteasa viral. Los nuevos ARN virales son luego transcritos de forma inversa por RT en moléculas de dsADN, que luego se envían de vuelta al núcleo y se insertan en nuevas ubicaciones dentro del genoma de la célula huésped. [12]

RT: Transcriptasa inversa.

VLPS: Partícula similar a un virus.

LTR : Repetición terminal larga.

Especies

Arquitecturas genómicas completas de semitivirus representativos.

El género contiene las siguientes especies: [13]

Referencias

  1. ^ Krupovic, M; Blomberg, J; Ataúd, JM; Dasgupta, yo; ventilador, h; Geering, AD; Gifford, R; Harrach, B; Casco, R; Johnson, W; Kreuze, JF; Lindemann, D; Llorens, C; Lockhart, B; Mayer, J; Müller, E; Olszewski, N; Pappu, recursos humanos; Pooggin, M; Richert-Pöggeler, KR; Sabanadzovic, S; Sanfaçon, H; Schoelz, JE; Sello, S; Stavolone, L; Stoye, JP; Teycheney, PY; Tristem, M; Koonin, EV; Kuhn, JH (4 de abril de 2018). "Ortervirales: un nuevo orden viral que unifica cinco familias de virus de transcripción inversa". Revista de Virología . 92 (12). doi :10.1128/JVI.00515-18. PMC  5974489 . PMID  29618642.
  2. ^ "Género: Semotivirus | ICTV". ictv.global . Consultado el 13 de octubre de 2024 .
  3. ^ Llorens, Carlos; Soriano, Beatriz; Krupovic, Mart; ICTV Report Consortium (2021). "Perfil de taxonomía del virus ICTV: Pseudoviridae". Revista de Virología General . 102 (3): 001563. doi :10.1099/jgv.0.001563. ISSN  1465-2099. PMC 8515867 . PMID  33528349. 
  4. ^ Soriano, Beatriz; Krupovic, Mart; Llorens, Carlos (2021). "Perfil taxonómico del virus ICTV: Belpaoviridae 2021". Revista de Virología General . 102 (11): 001688. doi :10.1099/jgv.0.001688. ISSN  1465-2099. PMC 8742986 . PMID  34761738. 
  5. ^ Llorens, Carlos; Soriano, Beatriz; Krupovic, Mart; ICTV Report Consortium (2020). "Perfil de taxonomía del virus ICTV: Metaviridae". Revista de Virología General . 101 (11): 1131–1132. doi :10.1099/jgv.0.001509. ISSN  1465-2099. PMC 7879559 . PMID  33048045. 
  6. ^ Llorens, C.; Futami, R.; Covelli, L.; Domínguez-Escriba, L.; Viu, JM; Tamarit, D.; Aguilar-Rodríguez, J.; Vicente-Ripollés, M.; Fuster, G.; Bernet, médico de cabecera; Maumus, F.; Muñoz-Pomer, A.; Sempere, JM; Latorre, A.; Moya, A. (29 de octubre de 2010). "La base de datos Gypsy (GyDB) de elementos genéticos móviles: versión 2.0". Investigación de ácidos nucleicos . 39 (Base de datos): D70 – D74. doi : 10.1093/nar/gkq1061. ISSN  0305-1048. PMC 3013669 . PMID  21036865. 
  7. ^ Massimiliano Marsano, Renè; Caizzi, Ruggiero (12 de septiembre de 2005). "Un análisis de todo el genoma de retrotransposones similares a BEL-Pao en Anopheles gambiae mediante el programa LTR_STRUC". Gene . 357 (2): 115–121. doi :10.1016/j.gene.2005.06.010. ISSN  0378-1119. PMID  16102916.
  8. ^ Krupovic, Mart; Blomberg, Jonás; Ataúd, John M.; Dasgupta, Indranil; Abanico, colgado; Geering, Andrew D.; Gifford, Robert; Harrach, Balázs; Casco, Roger; Johnson, Welkin; Kreuze, Jan F.; Lindemann, Dirk; Llorens, Carlos; Lockhart, Ben; Mayer, Jens (15 de junio de 2018). "Ortervirales: nuevo orden de virus que unifica cinco familias de virus de transcripción inversa". Revista de Virología . 92 (12). doi :10.1128/JVI.00515-18. ISSN  0022-538X. PMC 5974489 . PMID  29618642. 
  9. ^ Krupovic, Mart; Koonin, Eugene V. (15 de junio de 2017). "Las proteínas de la cápside homólogas dan testimonio de la ascendencia común de los retrovirus, los caulimovirus, los pseudovirus y los metavirus". Journal of Virology . 91 (12). doi :10.1128/JVI.00210-17. ISSN  0022-538X. PMC 5446648 . PMID  28356531. 
  10. ^ de la Chaux, Nicole; Wagner, Andreas (4 de junio de 2011). "Retrotransposones BEL/Pao en genomas de metazoos". BMC Evolutionary Biology . 11 (1): 154. Bibcode :2011BMCEE..11..154D. doi : 10.1186/1471-2148-11-154 . ISSN  1471-2148. PMC 3118150 . PMID  21639932. 
  11. ^ Llorens, Carlos; Soriano, Beatriz; Krupovic, Mart; ICTV Report Consortium (2020). "Perfil de taxonomía del virus ICTV: Metaviridae". Revista de Virología General . 101 (11): 1131–1132. doi :10.1099/jgv.0.001509. ISSN  1465-2099. PMC 7879559 . PMID  33048045. 
  12. ^ Soriano, Beatriz; Krupovic, Mart; Llorens, Carlos (2021). "Perfil taxonómico del virus ICTV: Belpaoviridae 2021". Revista de Virología General . 102 (11). doi :10.1099/jgv.0.001688. PMC 8742986 . PMID  34761738. 
  13. ^ "Taxonomía de virus: publicación de 2020". Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV) . Consultado el 7 de julio de 2021 .

Enlaces externos


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