Las pectobacterias son una familia de bacterias gramnegativas que en su mayoría son patógenos de plantas. Esta familia es miembro del orden Enterobacterales en la clase Gammaproteobacteria del filo Pseudomonadota . [1] La especie tipo de esta familia es Pectobacterium . [2]
El nombre Pectobacteriaceae se deriva del término latino Pectobacterium , que hace referencia al género tipo de la familia y al sufijo "-aceae", una terminación utilizada para denotar una familia. En conjunto, Pectobacteriaceae se refiere a una familia cuyo tipo nomenclatural es el género Pectobacterium . [1]
Los miembros de la familia producen ácido a partir de N-acetilglucosamina y son negativos a la arginina dihidrolasa, la ortinina descarboxilasa y la lisina descarboxilasa. Estas bacterias son catalasa-positivas, oxidasa-negativas y no producen disulfuro de hidrógeno.
Los análisis genómicos identificaron cuatro indeles de firma conservados (CSI) que son específicos de esta familia en las proteínas activador transcripcional RhaS , proteína motora flagelar MotB, una proteína histidina quinasa sensora de dos componentes y una proteína hipotética. [1] Estas firmas moleculares proporcionan un medio molecular confiable para distinguir a los miembros de la familia Pectobacteriaceae de otras familias en el orden Enterobacterales y otras bacterias.
Pectobacteriaceae , a partir de 2021, contiene ocho géneros publicados válidamente. [2] Los miembros de esta familia eran originalmente miembros de la familia Enterobacteriaceae , un gran grupo de especies filogenéticamente no relacionadas con características bioquímicas distintivas y diferentes nichos ecológicos. La asignación original de especies a la familia Enterobacteriaceae se basó en gran medida en análisis de secuencias genómicas de ARNr 16S, que se sabe que tienen un bajo poder discriminatorio y cuyos resultados cambian dependen del algoritmo y la información del organismo utilizado. A pesar de esto, los análisis aún exhibieron ramificaciones polifiléticas, lo que indica la presencia de subgrupos distintos dentro de la familia. [1]
En 2016, Adeolu et al. propusieron la división de Enterobacteriaceae en 7 nuevas familias basándose en análisis genómicos comparativos y el patrón de ramificación de varios árboles filogenéticos construidos a partir de secuencias genómicas conservadas, secuencias de ARNr 16S y análisis de secuencias de múltiples loci. También se identificaron marcadores moleculares, específicamente indeles de firma conservados , específicos de esta familia como evidencia que respalda la división independientemente de los árboles filogenéticos. [1]
