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Pseudomonas chlororaphis

Pseudomonas chlororaphis es una bacteria que se utiliza como inóculo de suelos en la agricultura y la horticultura . Puede actuar como agente de biocontrol contra ciertos hongos patógenos de plantas mediante la producción de antibióticos de tipo fenazina. [1] Según el análisis del ARNr 16S , se han incluido especies similares en su grupo. [2]

Un estudio genómico y filogenómico comparativo en 2020, analizó 494 genomas completos de todo el género Pseudomonas , siendo 43 de ellos cepas de P. chlororaphis . [3] En este estudio, se determinó la especie P. chlororaphis , con base en su monofilia y criterio de Identidad Nucleótida Promedio. Esta especie se encuentra dentro del complejo más amplio de especies P. fluorescens , según lo determinado por. [3] [4] [5] El recuento de proteínas y el contenido de GC de las cepas de esta especie oscilaron entre 5599 y 6401 (promedio: 6076) y entre 61,9 y 64% (promedio: 62,8%), respectivamente. [3] Además, los 43 proteomas de P. chlororaphis contenían 3587 proteínas centrales (compartidas entre todas las cepas de la especie), con 11 proteínas centrales específicas para ese grupo y, por lo tanto, ausentes en todas las demás cepas del género Pseudomonas . [3] Dos de estas 11 proteínas centrales específicas del grupo son una bacteriocina de la familia de las holinas y una proteína biosintética similar a la mitomicina y pueden conferir una ventaja competitiva contra otros colonizadores de raíces. [3]

ElPseudomonas chlororaphisgrupo

Pseudomonas chlororaphis da nombre a un subgrupo dentro del género Pseudomonas . Los otros miembros del subgrupo P. chlororaphis son P. aurantiaca , P. aureofaciens , P. fragi , P. lundensis y P. taetrolens . [2]

Referencias

  1. ^ Chin-A-Woeng TF, et al. (2000). "La colonización de raíces por la bacteria productora de fenazina-1-carboxamida Pseudomonas chlororaphis PCL1391 es esencial para el biocontrol de la podredumbre de la raíz y del pie del tomate". Mol Plant Microbe Interact . 13 (12): 1340–5. doi : 10.1094/MPMI.2000.13.12.1340 . hdl : 1887/62881 . PMID  11106026.
  2. ^ ab Anzai; Kim, H; Park, JY; Wakabayashi, H; Oyaizu, H; et al. (julio de 2000). "Afiliación filogenética de las pseudomonas basada en la secuencia del ARNr 16S". Int J Syst Evol Microbiol . 50 (4): 1563–89. doi :10.1099/00207713-50-4-1563. PMID  10939664.
  3. ^ abcde Nikolaidis, Marios; Mossialos, Dimitris; Oliver, Stephen G.; Amoutzias, Grigorios D. (24 de julio de 2020). "El análisis comparativo de los proteomas centrales entre los principales grupos evolutivos de Pseudomonas revela adaptaciones específicas de especie para Pseudomonas aeruginosa y Pseudomonas chlororaphis". Diversidad . 12 (8): 289. doi : 10.3390/d12080289 . ISSN  1424-2818.
  4. ^ Mulet, Magdalena; Lalucat, Jorge; García-Valdés, Elena (marzo de 2010). "Análisis basado en secuencias de ADN de las especies de Pseudomonas". Microbiología ambiental . 12 (6): 1513–1530. doi :10.1111/j.1462-2920.2010.02181.x. PMID  20192968.
  5. ^ Scales, Brittan S.; Dickson, Robert P.; LiPuma, John J.; Huffnagle, Gary B. (octubre de 2014). "Microbiología, genómica y significado clínico del complejo de especies Pseudomonas fluorescens, un colonizador de seres humanos no apreciado". Clinical Microbiology Reviews . 27 (4): 927–948. doi :10.1128/CMR.00044-14. ISSN  0893-8512. PMC 4187640 . PMID  25278578. 

Enlaces externos


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