Hasta 2011 Witmarsum perteneció al antiguo municipio Wûnseradiel, que se fusionó para formar Súdwest-Fryslân.
En la parte norte estuario del Marne juega un papel importante.
La mayoría de los montículos ahora existentes fueron excavados a finales del siglo XIX.
En las afueras de Wytmarsum hay un monumento en el lugar donde Menno predicó.
Se sabe que ya en el siglo X había una iglesia en ese lugar y para el año 1200 la iglesia contaba con una torre cubierta a dos aguas pero, 1631 fue destruida en gran parte por las tormentas.