No obstante, no tuvo suerte en la fase de ascenso y fue el año siguiente el del salto a la Primera valenciana, que la disputó en la temporada 1949-50.
Pero tras unos años sin equipo oficial, en 1965 volvió a surgir un nuevo proyecto para la refundación del club, que conllevó el pago de las deudas de años atrás para que la federación le permitiera inscribirse con el mismo nombre que el histórico club.
Su primera temporada la disputó en Tercera Regional; y tras varios años, el club experimentó varios ascensos, hasta que disputó su primera temporada en Preferente en la 70/71, y dos años más tarde la Tercera División.
Estuvo en esta categoría durante dos años, en los que cosechó un 12º puesto en la primera de ellas.
El Vinaròs CF disputaba sus encuentros en el Campo Cervol, que fue inaugurado dos meses después de la refundación del club y era propiedad del ayuntamiento desde 1987.