Más tarde habría de cambiar su nombre a Instituto Científico y Literario en 1871.

La Universidad Autónoma de Aguascalientes funcionará como organismo público descentralizado del Estado con personalidad jurídica propia para adquirir y administrar bienes.

La Universidad examinará todas las corrientes del pensamiento humano, los hechos históricos y las doctrinas sociales, con la rigurosa objetividad que corresponde a sus fines.

[6]​ El lema de la UAA es “Se lumen proferre”, que significa “Proyectarse luz”.

Gómez Portugal nació en Aguascalientes hacia el año de 1818 y murió en San Luis Potosí en 1875.

En 1871 fue llamado a ocupar la primera magistratura del Estado, por el voto unánime de los ciudadanos, haciéndose cargo del elevado puesto, bajo un programa de conciliación que otorgaba toda clase de garantías y que supo llevar debidamente durante su periodo constitucional.

En 1873 se inician las carreras de Jurisprudencia y Farmacia; la primera funcionó hasta 1877.

En esta época se trataba de formar a los hombres claves del Porfirismo, a su élite social, para lo cual se tenían materias de adoctrinamiento que se impartían estratégicamente en el quinto y último año lectivo de sus estudios preparatorianos.

El gobernador Alejandro Vázquez del Mercado reducía las metas del Instituto a los términos siguientes: "Disciplina escolar uniforme y bien sostenida; moralidad suma en los alumnos que aprenden desde los primeros años a ser sumisos, respetuosos y cumplidos con sus deberes; aplicación de los alumnos y dedicación en los profesores; dirección bien organizada".

Se integró una comisión integrada por el doctor José González Saracho, ingeniero Efraín Cobar Lazo, doctor Rafael de la Torre y el licenciado Guillermo Moreno Rodríguez.

Los últimos periodos rectorales en el Instituto Autónomo de Ciencias y Tecnología fueron cubiertos por el licenciado Benito Palomino Dena (1960-1965), ingeniero Carlos Ortiz González (1966-1968), doctor Álvaro de León Botello (1969-1971), y el contador público Humberto Martínez de León (1972-1974).

Con el licenciado Benito Palomino se establecen las carreras técnicas de Enfermería y Obstetricia y Contador Privado, más tarde, en 1963, se funda la carrera de Trabajo Social.

Otro aspecto que conviene señalar, es que se solicitan a las autoridades gubernamentales la donación de un terreno en donde se proyectaba construir las instalaciones para la carrera de Medicina.

Lista de rectores del antiguo Instituto[8]​ Durante este período fungió reconocido por los catedráticos, primero el químico Eusebio Sánchez Zarzosa y después el químico Benjamín Vargas Tapia.

Alejandro Topete del Valle, Dr. Álvaro de León Botello, CP.

José Luis González Marmolejo, Dr. Alfonso Pérez Romo, Sr. Eudoro Fonseca Yerena, Lic.

En el número 45 del propio Periódico Oficial, mismo tomo, se publicó una fe de erratas al artículo 20.

La comisión de estilo estuvo integrada por los licenciados Carlos González Rueda, Manuel Varela Quezada, José Luis Serna Valdivia y Guillermo Ballesteros Guerra.

Los Centros de que se compone y las carreras que imparte son: La UAA ha tenido los rectores siguientes: El lema de la universidad es “Se lumen proferre”, locución latina que significa “proyectarse en luz”, la cual fue escrita por el poeta Desiderio Macías Silva.

El autor, en la primera estrofa resalta el lema universitario y la complementa con la palabra Universitas (Universidad), que permite al compositor reflejar su idea musical.

La música da principio con una «Cuarta» (fado) para dar la sensación de lo indígena (caracoles marinos, huéhuetl, teponaztli, chirimía), continúa con un «tono menor» que significa la lucha entre lo indígena y lo hispano y termina, la primera parte, con un «tono mayor», símbolo de una nueva nacionalidad.

Para la adopción de la mascota universitaria, se hizo un concurso entre el alumnado y todas las personas que quisieran participar en la creación; hubo varias propuestas que iban desde figuras representativas de ardillas, abejas, venados, pero el gallo fue el que tuvo mayor aceptación.

El Gallo refleja la alegría, la fuerza y liderazgo de la juventud.

Esta ave tiene la cresta erguida, pico ganchudo, arcos prominentes, ojos vivaces, plumaje ceñido, fuerte estatura, tronco ovalado y posición tan erguida que el cuello, pecho y patas casi cubren una línea vertical.