Este taxón fue descrito originalmente en el año 1908 por el zoólogo francés, radicado en la Argentina, Fernando Lahille.
[1] Durante buena parte del siglo XX este taxón fue tratado como un sinónimo de Tursiops truncatus, el delfín más común y conocido en todo el mundo.
En el año 2016, los zoólogos Janaína Carrion Wickert, Sophie Maillard von Eye, Larissa Rosa Oliveira e Ignacio Benites Moreno estudiaron en detalle las poblaciones reconocidas como Tursiops truncatus del océano Atlántico sudoccidental, mediante análisis uni y multivariados, testeando diferencias morfológicas (14 caracteres) y morfométricos (29 medidas) entre dos agrupamientos detectados en la zona; el resultado permitió reconocer a estos como pertenecientes a dos formas morfológicas distintas, de conformidad con el concepto filogenético de especie, lo que se tradujo en la revalidación de Tursiops gephyreus como un taxón válido, asignándole los investigadores un nivel de especie.
[3] Este delfín puede ser reconocido de T. t. truncatus mediante 6 caracteres cualitativos aunque, la forma del proceso nasal del premaxilar derecho es suficiente para poder separarlas.
[2] La localidad de Las Toninas fue nombrada así por la presencia de Tursiops t. gephyreus, visibles desde la costa a principios del siglo XX.