Sería nombrado director técnico del equipo en 2012 y se convirtió nuevamente en candidato para el puesto en 2016.

Namibia fue eliminada en los cuartos de final a manos del eventual campeón y anfitrión Sudáfrica.

Sin embargo, quizás su resultado más impresionante llegó en Durban, cuando Namibia empató 1-1 con Sudáfrica después de liderar durante gran parte del juego.

Bajo su liderazgo, Namibia subió 34 lugares en la Clasificación mundial de la FIFA hasta la posición más alta que había logrado en los últimos 10 años.

Saintfiet había entrenado al equipo antes del partido, aunque tuvo que abandonar el campamento por problemas con los permisos de trabajo.

Saintfiet mostró nuevamente una defensa bien organizada, con su equipo concediendo solo un gol en los primeros cinco partidos con él a cargo.

En un Estadio de Adís Abeba lleno, los fanáticos vieron a Etiopía tomar la delantera durante la mayor parte del juego, solo para que el capitán de Nigeria Joseph Yobo anotara en el minuto 86 para rescatar un punto.

Por lo tanto, no pudo obtener una visa de trabajo para ingresar a Nigeria.

[8]​ En julio de 2012, Saintfiet se hizo cargo del Tanzania club Young Africans SC.

[12]​ El objetivo era clasificar a Malaui por primera vez en la historia para la Copa del Mundo, pero no lo consiguió.

Dos años más tarde, el presidente de la FAM declaró en una entrevista con la BBC que sus malos resultados de los últimos dos años (2014-2015) se debieron a no haber fichado antes al Saintfiet.

Saintfiet guio a Togo hacia la clasificación para la Copa Africana de Naciones 2017.

En los cuatro partidos que disputaron con Saintfiet a la cabeza, el equipo perdió 2-1 ante la Nicaragua y luego los derrotó 3-1.

Por esta razón, Saintfiet ni siquiera pudo seleccionar a sus mejores jugadores locales.

[23]​ Debutó en un empate 1-1 contra la Argelia válido para la clasificación a la Copa Africana de Fútbol 2019.

[28]​ Terminaron con los mismos puntos como Malí, que, sin embargo, ganó el grupo debido a una mejor diferencia de goles en general.