El formato de competencia varía respecto a las temporadas anteriores.

[2]​ A pocas fechas de finalizar el Torneo Apertura, los equipos Deportivo Upata FC y Yaddiel Sport FC desistieron de seguir en competencia.

Luego, los equipos Unión Lara SC y Yaracuyanos FC B también se dieron de baja, y pocos días antes del inicio del Clausura, tanto Lotería del Táchira FC como Libertad Socialista FC desistieron de seguir participando en la temporada.

Las 6 bajas producidas entre el Final del Apertura y el comienzo del Clausura, derivaron en una serie de cambios, los cuales fueron: Debido a que los 6 grupos de competencia no tendrían la misma cantidad de partidos disputados al finalizar la temporada (con lo explicado anteriormente), los 2 mejores segundos se determinarán dividiendo la cantidad de puntos obtenidos entre los partidos disputados, teniendo en consideración la suma de puntos en ambos torneos Apertura y Clausura.

Datos actualizados al: 7 de octubre de 2016 (Jornada 10) Pts = Puntos; PJ = Partidos jugados; G = Partidos ganados; E = Partidos empatados; P = Partidos perdidos; GF = Goles anotados; GC = Goles recibidos; Dif = Diferencia de goles La Liguilla se jugará cuando finalicen los dos Torneos, donde clasifican los primeros lugares de cada grupo y los 2 mejores segundos, teniendo en consideración la suma de puntos en ambos Torneos Apertura y Clausura.