Juega de defensa y su equipo actual es el Middlesbrough FC del Football League Championship de Inglaterra.
Stephen McManus, que actúa como lateral izquierdo o como defensa central, ha jugado siempre en el Celtic de Glasgow.
Empezó en las categorías inferiores hasta que, en 2003, pasa a formar parte de la primera plantilla del club.
En la temporada 2007/08 se convierte en capitán del equipo.
En julio del 2010 es traspasado al equipo inglés, Middlesbourgh, recién descendido de la Barclays Premier League de Inglaterra.