El equipo jugó en la Liga Premier de Azerbaiyán, la primera división del fútbol azerí, y disputaba sus partidos como local en el estadio Şəmkir.

El club fue fundado en 1954 y nunca participó en algunas de las ligas profesionales del fútbol soviético.

[2]​ En 2005, el Shamkir estuvo próximo a su desaparición debido a razones de patrocinio y regresó de nuevo en 2009 tras encontrar nuevos patrocinadores,[3]​ pero tuvo que comenzar participando en la Birinci Divizionu, la segunda división azerí hasta su desaparición en 2017.

El estadio fue reconstruido en 2002 y después de la reconstrucción puede acoger 11.500 espectadores.

1999-00, 2000–01, 2001-02 1994-95 A continuación se muestran los últimos entrenadores que han dirigido al club: