Sébastien Frey (Thonon-les-Bains, Francia, 18 de marzo de 1980) es un exfutbolista francés que jugaba de portero.
Es hermano, del también jugador de fútbol Nicolas Frey.
Ha sido internacional con la selección de fútbol de Francia en dos ocasiones.
Formó parte del equipo que disputó la Eurocopa 2008, siendo suplente de Grégory Coupet.
Un mes después de finalizar la Eurocopa, Frey anunció su retiro de la selección para centrarse en su carrera en clubes.