En esa ciudad, ejerció como cirujano en el Edinburgh Foundling Hospital.
A pesar de que nunca publicó los dos volúmenes restantes, su obra es habitualmente citada como fuente taxonómica para una gran cantidad de especies.
Entre sus obras se incluye un monumental estudio histórico en dieciocho volúmenes, titulado A General History and Collection of Voyages and Travels - Arranged in Systematic Order: Forming a Complete History of the Origin and Progress of Navigation, Discovery, and Commerce, by Sea and Land, from the Earliest Ages to the Present Time.
Kerr comenzó esta serie en 1811, dedicándola a Sir Alexander Cochrane.
Los últimos volúmenes se publicaron póstumamente, durante la década de 1820.