Los principales temas de relaciones entre España y Madagascar son: La cooperación al desarrollo, aunque Madagascar no es un país preferente en el Plan África.La pesca, puesto que Madagascar se encuentra en la ruta de los atuneros españoles que pescan en el Océano Índico.En 2009 ocurrió un hecho similar, tras el apresamiento del pesquero “Alakrana”.Toda la tripulación fue finalmente liberada.Con cargo al presupuesto AECID (DG relaciones Culturales y Científicas) se ha financiado hasta 2012 un lectorado en la Universidad de Antananarivo.
