Fue fundado en 2009 al tomar el lugar en la liga del equipo Vaqueros de Agua Prieta.

Una historia que todo club deportivo persigue es el bicampeonato, y Rayos ya lo logró.

Cuentan con 2 campeonatos al hilo en la liga, en la temporada 2012 venciendo a los Ostioneros de Guaymas en 7 juegos, y en la temporada 2013 imponiéndose por un punto a la Garra Cañera de Navolato en 7 juegos.

El jueves 27 de junio lograron el campeonato por barrida en la serie final con 4-0, frente a una abarrotada Arena Sonora, logrando con ello ser el máximo ganador de CIBACOPA en solitario con 4 estrellas.

En las temporadas 2016 y 2017 la quinteta hermosillense llegó a la final pero cayó en ambas oportunidades, por serie de 4-2.