Nygaard, jefe de prensa durante varias temporadas del Saxo Bank dirigido por Bjarne Riis, se encontraba en ese momento en el Sky, que se estrenaba ese año como el primer equipo británico de categoría ProTour.[31] En el tríptico de clásicas, monopolizado ese año por Philippe Gilbert, Andy estuvo cerca en la Amstel Gold Race cuando fue cazado a 1 km para meta, carrera en la que Jakob Fuglsang finalizó 4.º.[34] La baja de Bennati hizo que el clasicómano y rápido belga Wouter Weylandt se convirtiera a última hora en el jefe de filas para la ronda italiana, la primera gran vuelta en la que participaría la formación.[36] Su muerte conmocionó al pelotón, que en la siguiente etapa le recordó en una jornada de duelo: los ciclistas renunciaron a disputar el triunfo, y el pelotón en bloque completó el recorrido de la cuarta etapa turnándose en los relevos los distintos equipos para dejar que fueran sus compañeros del Leopard Trek y su mejor amigo Tyler Farrar, quienes cruzaran en primer lugar la línea de meta, abrazados y visiblemente abatidos por la pérdida;[37] el montante de los premios que debían entregarse ese día fue para la familia del malogrado corredor.[38] A la conclusión de esa jornada el equipo decidió abandonar la carrera para asistir al funeral que se celebraría en Gante.Los Schleck junto a Fabian Cancellara, Maxime Monfort y Jakob Fuglsang quedaron en el primer grupo dejando atrás al principal rival en los papeles, Alberto Contador.[43] Evans hizo la contrarreloj 2'31" más rápido que Andy Schleck, relegándolo al segundo lugar de la clasificación, mientras Frank quedaba tercero.[45] En la tercera gran vuelta de la temporada, la Vuelta a España, el equipo comenzó ganando la contrarreloj por equipos en Benidorm, lo que permitió que el danés Jakob Fuglsang tomara posesión del maillot rojo.En la clasificación general, Maxime Monfort ocupó el sexto lugar y Jakob Fuglsang undécimo.[52] El propietario de la sociedad Leopard aseguró asimismo que el hasta entonces mánager general del Leopard Trek, Brian Nygaard, saldría del equipo con carácter inmediato;[53] esa circunstancia se materializó un día después con un comunicado oficial de la escuadra.[54] Nygaard explicó que si bien Becca le había ofrecido desempeñar otro cargo en la estructura resultante, su salida fue prácticamente un despido.[60] Tras la fusión de ambos equipos las expectativas se situaron muy altas ya que tenían corredores para dominar gran parte del calendario.[62] En la Tirreno-Adriático, Chris Horner terminó 2.º en la carrera, sólo superado por Vincenzo Nibali, mientras que Cancellara ganó la contrarreloj final.[64] En una carrera que pelearon palmo a palmo Ryder Hesjedal y Joaquim Rodríguez, Schleck no estaba muy lejos de las primeras posiciones (incluso fue 3.º en la séptima etapa), pero una caída en la undécima jornada, le afectó el hombro y acabó abandonando en la 15.ª.[66] El menor de los Schleck, además ya venía teniendo una temporada magra, abandonando en la París-Niza, la Volta a Cataluña[67] y con pobres actuaciones en las clásicas.[69] A su vez, Bruyneel se encontraba en un escándalo tras la acusación hecha por la USADA (Agencia Estadounidense Anti-Dopaje) por su implicación en la trama de dopaje en el US Postal cuando era su director.Con un equipo sin mayores aspiraciones, se presentó en la Vuelta a España donde lo más destacable fue una victoria de etapa para Daniele Bennati.[76] A lo largo del 2012 se produjo cierta polémica sobre todo en España debido a que los corredores españoles Haimar Zubeldia, Markel Irizar y el masajista Igor Díez aparecen tanto en la web oficial como en su autobús con la bandera vasca en vez de con su bandera nacional como el resto de corredores.Tour Down Under, Tour del Mediterráneo, Tirreno-Adriático y Vuelta al País Vasco fueron las carreras que no logró finalizar durante los primeros meses del año, llegando solo en el Gran Premio Camaiore.El motivo eran problemas financieros, aunque se especuló que la situación de los hermanos Schleck también había pesado en la decisión.[83] Mientras tanto Fabian Cancellara nuevamente salvaba la actuación del equipo haciendo una excelente temporada en las clásicas.Trek anunció que continuaría en 2014 con la misma base, con Luca Guercilena como mánager y Fabian Cancellara como líder.La nota destacada del equipo la dio Jan Bakelants al ganar la 2.ª etapa y vestirse de amarillo por dos jornadas, pero poco más.Maxime Monfort, fue el mejor en la 14.ª posición y Andy Schleck, aunque no estuvo adelante en los momentos en que se definía la carrera culminó en un meritorio 20º lugar.[87] Esto se confirmó a finales de julio cuando la empresa estadounidense comunicó que había firmado con ambos.[96] Así Chris Horner con casi 42 años ganó su primera carrera grande y también fue la primera del equipo a nivel individual, aunque esto no sirvió para permanecer en la escuadra en 2014 ya que no firmó con el nuevo Trek Factory Racing.Luca Guercilena pasó a ser el director deportivo general, siendo sus auxiliares Kim Andersen, Alain Gallopin, José Azevedo, Lars Michaelsen y Dirk Demol.De los ciclistas sub-23 quién más destacó fue Bob Jungels, con victorias en la Flecha del Sur, París-Roubaix sub-23 y Triptyque des Monts et Châteaux entre otras.Los más destacados de la temporada fueron el italiano Eugenio Alafaci con la victoria en la Omloop der Kempen y podio en Gran Premio Criquielion.[100] Pero posteriormente la sociedad Leopard S.A aseguró que el equipo continuará y con la misma filosofía de darles oportunidad a ciclistas jóvenes.
