Fue fundado en 2004 mediante la fusión de dos equipos y juega en la Virsliga, máxima categoría nacional.
El nuevo equipo tardó seis años en retornar a la máxima categoría, tras quedar primero en la edición de 2009.
[1] Sin embargo, sus actuaciones en Liga se limitaban a asegurar la permanencia.
Bajo las órdenes del entrenador Vitālijs Astafjevs, el FK Jelgava se proclamó campeón de la Copa de Letonia durante tres años consecutivos (2014, 2015 y 2016).
[2] Valērijs Redjko Anatoliy Sydenko Aleksandrs Proskurnins Andrejs Adamovics Liene Bricka Plantilla en la web oficial