Stewart volvería a interpretar el papel en la película Logan (2017) y en la película de Marvel Cinematic Universe (MCU) Doctor Strange en el multiverso de la locura (2022), mientras que McAvoy aparecería como su versión más joven del personaje en X-Men: Apocalipsis (2016), Deadpool 2 (2018) y Dark Phoenix (2019).

Por suerte, el nonato Charles fue capaz de hacer frente a esta terrible amenaza (que más tarde evolucionaría como la criatura llamada Cassandra Nova).

Tras la muerte de Brian Xavier en un misterioso accidente, su amigo y socio, Kurtis Marko, se casa con su viuda, Sharon.

Xavier y Magnus se revelan sus poderes cuando pelean contra el agente nazi Baron Wolfgang von Strucker y sus soldados de Hydra, para liberar a Gabrielle, que había sido raptada para proporcionales una gran cantidad de oro que había podido ocultar antes del Holocausto.

Al entender que ambos puntos de vista sobre las relaciones entre mutantes y humanos son incompatibles, Magnus se marcha con el oro.

Xavier se reencuentra con su exnovia Moira, quién ahora está divorciada y ha fundado un centro de investigaciones científicas en la Isla Muir, en Escocia.

Xavier contrata al mutante metamorfo llamado Changeling para que tome su apariencia y lo reemplace con los X-Men mientras él parte a su misión.

Cuando los X Men son capturados por la criatura conocida como Krakoa, la Isla Viviente, Xavier organiza un nuevo equipo para su rescate con ayuda de la Dra.

Lilandra huía a la Tierra trayendo consigo el Cristal M'Kraan, una gema mística de gran poder que D'Ken planeaba utilizar para dominar al universo.

Xavier une fuerzas con Sebastian Shaw, el líder del Club Fuego Infernal, pues la asistente de este, Tessa, también fue capturada por Pierce.

[14]​ Los X Men volveron del espacio y liberaron a Xavier, pero ya era tarde para evitar que se convirtiera en una "Reina Brood".

[13]​ Los X Men descubrieron esto y liberaron a Xavier, pero ya era tarde para evitar que se convirtiera en una Reina Brood.

Lilandra, quien mantiene un enlace psíquico con Xavier, siente que él corre un grave peligro y se encamina a la Tierra.

Por desgracia, la terrible criatura Mummudrai llamada Cassandra Nova, que acecha a Xavier desde el vientre materno, finalmente ataca.

Danger huye, pero no sin antes revelar a Coloso que Xavier sabía de su forma humanoide y su capacidad para sentir desde su última actualización.

[46]​ Pero el poderoso Hulk regresó poco después, buscando venganza contra los Iluminatti ya que, en su exilio, quedó varado en un lejano planeta donde se casó y tuvo un hijo.

Siniestro había establecido a Xavier, Sebastian Shaw, Juggernaut y Carter Ryking (Hazard) como posibles nuevos anfitriones para su mente.

Allí forma parte del Consejo de Utopía junto con Cíclope, Tormenta, Namor, Bestia, Iceman, Wolverine y Emma Frost.

Xavier decide enfrentar a la criatura, que ahora transformada en la versión maligna, Fénix Oscura, se ha apoderado únicamente del cuerpo de Cíclope.

En la ONU, Xavier, Bestia y Emma Frost, celebran con otros embajadores el reconocimiento de Krakoa como nación soberana.

Mientras Wolverine expresa sus dudas sobre el próximo evento, Xavier y Magneto le aseguran que todo estará bien.

Poco después, varios mutantes villanos, incluidos Mister Siniestro, Sebastian Shaw, Exodus, Selene y Apocalipsis, llegan a través de los portales.

[70]​ Cuando Jean despierta como El Fénix y escapa, Xavier la sigue hasta su antigua casa e intenta convencerla de que regrese.

Después de muchas discusiones, El Fénix muestra sus grandes poderes mientras intenta evitar que Xavier reestablezca los bloqueos psíquicos para encerrarla nuevamente.

Uno de los escritores señaló que este es un hermano gemelo escrito exclusivamente para esa escena el cual nació con muerte cerebral (debido al enorme poder del Profesor X).

Este hermano aparentemente puede caminar pero se argumenta que está con movimientos restringidos porque estuvo en coma por un largo tiempo y con muerte cerebral desde su nacimiento.

El Profesor X aparece por unos momentos al final de X-Men Origins: Wolverine (2009), interpretado nuevamente por Patrick Stewart.

El actor declaró en una entrevista con The Huffington Post que será más viejo y perderá su cabello en este film.

Conducen hacia Dakota del Norte mientras la cuidadora anterior de Laura les informaba que un refugio seguro para mutantes se encontraba cerca.

[83]​ Stewart inicialmente declaró que Logan sería su actuación final como el personaje,[84]​ aunque más tarde se retractó expresando su interés en repetir su papel para la serie Legion de FX.