Ante los diversos problemas que surguieron con las Asociaciones y la FBF el año anterior y en el transcurso del mismo, la Liga decidió organizar dos campeonatos en la gestión 1979, un Torneo Apertura llamado Copa LPFB y un Torneo Clausura llamado Copa Eduardo Avaroa.
Los clubes fueron clasificados por puntos y los criterios de desempate fueron en el siguiente orden: diferencia de goles, goles marcados y resultados directos entre equipos empatados.
Aquí se incorporaron los clubes 31 de Octubre y Ferroviarios, para lo cual se decidió formar dos grupos de tres equipos ordenados por sorteo, cada grupo jugaría un torneo triangular típico donde los dos primeros clasificarían a la Fase Definitoria.
El Campeón y subcampeón del torneo clasificaron a la Copa Libertadores 1980.
La disputaron The Strongest y Oriente Petrolero tras ganar sus respectivas llaves de semifinales.