El torneo se inició según la planificado, el último trimestre del año, pues se debía inscribir a los clubes ganadores (campeón y subcampeón) para la copa Libertadores de América 1969 hasta fin de año.
El torneo se llevó a cabo sin más inconvenientes hasta el 15 de diciembre, dado el empate en puntos en el segundo lugar se debió llevar a cabo un partido de desempate, sin embargo, como comentaremos más tarde, esto no sucedió así.
Para definir el subcampeonato y según convocatoria se debía realizar un partido extra dado el empate en puntos, por lo que el mismo comité profesional de la FBF determinó que, una vez terminado el campeonato el día 15 de diciembre, se juegue este partido definitorio entre Guabirá y Litoral, en la ciudad de La Paz como campo neutral (incluso debía llamarse a árbitros extranjeros para ese lance) y el día 19 de diciembre.
Entonces surgió el problema: Impugnación del partido jugado de la fecha 8 entre Blooming y Guabirá (que terminó empatado) por la alineación indebida de 3 jugadores extranjeros por parte de Blooming, lo que era cierto y "sospechosamente" levantó especulaciones... Guabirá exigió los dos puntos, con lo que sería proclamado subcampeón sin necesidad del partido extra.
Pese a esto Guabirá rehusaba su presentación y solicitó audiencia directa con personeros de la CSF.