Como su nombre indica ('port del pi', puerto del pino en castellano), desde la antigüedad y hasta la Edad Moderna la cala fue el puerto de la ciudad y de este uso quedan importantes monumentos.
Hay que escribirlo en una, porque no se trata de un compuesto.
En la versión latina del mismo libro, en cambio, se encuentra Portis Pini, de acuerdo con la etimología.
En el año 1331 había un pelotón de sirvientes con dos trabuquetes y se promulgaron unas ordenanzas sobre las guardias de noche en los barcos, las torres y los ingenios, y en 1443 en la torre de Paraires había el siguiente armamento: 2 bombardas, 2 bombardas mediadoras, 10 buçons, 5 ballestas, 10 lanzas largas, 6 lanzas manereses o manuales y munición para las armas de fuego.
En el año 1613 se empezó a construir la fortaleza de San Carlos, que cruzaba su fuego con la torre del jefe del Muelle, ubicada bajo el castillo de la Almudaina.
En 1906 se instaló el primer laboratorio oceanográfico, que con diferentes nombres ha permanecido hasta la actualidad.
También hubo una cantera para la construcción del nuevo puerto, donde después se construyó una fábrica de adobos químicos (1913).
Aprovechando este hecho, ETA planeó un atentado contra el rey Juan Carlos I en verano de 1995, desde un piso en los alrededores, pero la policía logró impedirlo.
Entre 1880 y 1890 se demolió la capilla para ampliar la cantera y se construyó una nueva capilla, que volvió a ser trasladada a finales del siglo XX para la construcción de un centro comercial.