Pedro Luis Alonso Fernández (Madrid, 18 de marzo de 1959) es un médico, epidemiólogo e investigador español, experto en las enfermedades que afectan a las poblaciones más pobres del planeta.

Su trabajo se ha centrado sobre todo en el estudio de la malaria, aunque incluye también otras enfermedades infecciosas, abordadas siempre desde una perspectiva multidisciplinar.

Durante años, el CISM fue el único centro en África en contar con un sistema de vigilancia demográfica (una herramienta clave para la investigación clínica) y fue pionero en la realización de grandes ensayos clínicos en este continente, lo que le valió ser reconocido en 2008 con el Premio Príncipe de Asturias a la Cooperación Internacional, junto con otros 3 centros africanos.

A nivel internacional, el Dr. Alonso participó, junto con Fred Binka, en la creación del European and Developing Countries Clinical Trial Partnership, un organismo conjunto de países europeos y africanos cuyo objetivo es promover y financiar el desarrollo de nuevas herramientas contra la malaria la tuberculosis y el Sida, que ha sido clave en la promoción de la investigación en los países en desarrollo.

Asimismo, y como parte de un cambio de paradigma que hace que la erradicación de la malaria sea actualmente un objetivo compartido por la comunidad internacional, Pedro L. Alonso lideró, junto con Marcel Tanner , la Malaria Eradication Research Agenda (malERA), una iniciativa que definió las necesidades de investigación y desarrollo para erradicar esta enfermedad, cuyos resultados se publicaron en 2011[10]​ en la revista PLoS Medicine y que derivó luego en la creación de la Malaria Eradication Scientific Alliance (MESA).

Ha recibido, entre otros reconocimientos, los siguientes premios: Pedro L. Alonso está casado con Clara Menéndez, investigadora especializada en el área de la malaria en mujeres embarazadas, y tiene tres hijos: Yara, Miguel y Sofía.