Durante la Primera Guerra Mundial, Wagener se desempeñó como oficial en el Ejército Imperial Alemán antes de ser enviado al Estado Mayor en 1916.

Después de la guerra, participó en la defensa de Posen (ahora Poznań, Polonia), pero tuvo que huir a los Estados bálticos para evitar el arresto.

Allí, unificó a los Freikorps en la Legión Alemana y asumió el liderazgo de esta última.

En 1929, Wagener se unió al Partido Nacionalsocialista Obrero Alemán y la SA, bajo la influencia de su excompañero de los Freikorps, Franz Pfeffer von Salomon.

Aufzeichnungen eines Vertrauten 1929-1932, que fueron publicadas de forma póstuma en 1978.