Su sección más laureada es el equipo de fútbol femenino, con el que ha conseguido algunos logros a nivel nacional.

A finales de los 80, se creó la Primera División Femenina de España, pero el Oiartzun no alcanzaría la máxima categoría hasta la temporada 1990/91, en la que no solo debutó, sino que conquistó el título liguero en una disputa muy reñida, en la que tanto Oiartzun, Añorga KKE y Atlético de Madrid empataron a puntos.

Tras superar esas dificultades económicas, Oiartzun volvió a contar con una sección de fútbol femenino que sorprendió con su gran ascenso de nuevo a la primera división en la temporada 2015/16, tras eliminar al Madrid CFF y al FVPR El Olivo.

De esta forma el Oiartzun KE, entrenado por Jon Alkorta, jugó en 1.ª división por tercera vez en su historia, tras haber estado en categorías inferiores durante 23 años.

Pese a haberse fundado 6 años antes que la sección femenina, el Oiartzun masculino ha tenido una historia mucho más modesta que el equipo femenino.