El concurso fue presentado por Jack Wagner; como comentaristas, actuaron Julie Moran y Ali Landry, Miss USA 1996.

[3]​ Binibining Pilipinas Mundo 1999 Miriam Quiambao reemplazó a Janelle Bautista como Binibining Pilipinas Universo 1999 luego de que esta última renunciara al título debido a un problema con su ciudadanía.

Bulgaria, Guam, Noruega, Países Bajos, Rumania y Zimbabue se retiraron.

Al igual que en 1998, se seleccionaron diez semifinalistas mediante una competencia preliminar y entrevistas a puerta cerrada.

El panel de jueces estuvo conformado por las siguientes diez personas:[12]​ 84 candidatas compitieron por el título.