Interpretó al General Zod en las películas de DC Extended Universe Man of Steel (2013) y The Flash (2023).

[1]​ Pasó los veranos y las navidades en Chicago, cuando su padre se mudó ahí cuando él tenía cinco años.

Sus papeles en Bug, Killer Joe y Man From Nebraska fueron escritos por Tracy Letts, integrante de Steppenwolf.

[6]​ Su primer papel fue como protagonista del videoclip de la banda Every Mother's Nightmare "House of Pain", donde interpreta a un problemático joven.

[7]​ Shannon hizo su debut en el cine con un pequeño papel en Groundhog Day en 1993 como un novio de una boda.

En 2006, interpretó a Lynard, el líder de un grupo neonazi en la comedia Let's Go to Prison.

[11]​ En 2009, fue confirmado como integrante del reparto de la serie Boardwalk Empire,[12]​ junto a Steve Buscemi, Kelly Macdonald, Michael Pitt y Stephen Graham.

[13]​ En 2012, protagonizó al legendario asesino a sueldo Richard Kuklinski en The Iceman, que fue distribuido en mayo de 2013.

En 2016, volvió a Broadway con la aclamada obra Long Day's Journey into Night donde interpretó al personaje James Tyrone Jr.

Por su papel en Nocturnal Animals fue nominado a los Premios Óscar del año 2017 como mejor actor de reparto.