Fundó la banda de death metal Carnage en 1988 con Johan Liiva como cantante y lanzó dos demos bastante conocidos, ganando el interés público.

Incluyendo al baterista Daniel Erlandsson, su primer álbum, Black Earth era intencionado con ser un solo proyecto, pero el primer sencillo ("Bury Me An Angel") fue cordialmente recibido en MTV Japón y en 1997 Arch Enemy firmó con otra firma japonesa, Toy's Factory, así fueron invitados a una gira en Japón.

Michael decidió formar la banda completa, reclutando a Peter Wildoer (Darkane) y al bajista Martin Bengtsson.

Después de la gira en Japón, Michael regreso a Spiritual Beggars y lanzó Mantra III en 1998, ahora con Per Wiberg en teclados.

En abril del mismo año, Arch Enemy regresó con Stigmata, su primer álbum fuera de Japón, ahora en Century Media.

Arch Enemy lanzó Wages of Sin en 2001, y fue bien impulsado por la nueva cara, la banda hizo un éxito a nivel mundial.

Michael no regresó a Spiritual Beggars hasta 2002, año en el que lanzó On Fire, otra vez en Music for Nations.

En el 2007, luego de finalizar la gira latinoamericana, grabó junto a Arch Enemy un nuevo disco, "Rise Of The Tyrant".

Michael escribió las letras de "Tempore Nihil Sanat (Preludio F menor)", "Never Forgive, Never Forget", "War Eternal", que fue la primera canción en relevarse mediante un vídeo oficial, "You Will Know My Name" de la cual se hizo un vídeo oficial, "Stolen Life" y "Down To Nothing".

Las mayores influencias en su música han sido Tony Iommi, Michael Schenker, Uli Jon Roth, Frank Marino y Dave Mustaine.

El estilo de Amott incluye un ancho vibrato, líneas melódicas, riffs agresivos y un gusto por las dobles guitarras armonizadas.