Fueron miembros de la Cervecería Boliviana Nacional quien, a la cabeza de los señores: Ramón Manuel Zapata, Ángel Fuentes, Francisco Sánchez, Darío Ortiz, Mario Maldonado, Hugo Córdova, Ismael Prieto, Carlos Buezo, Evaristo Roncal, Hugo A. Valencia, entre otros; dieron inicio a la institución "blanquinegra" ejerciendo como parte del primer directorio del club.

En 1999, bajo la presidencia del Dr. Luis Alípaz, Mariscal Braun logra su tercer título en la AFLP, tras vencer a Litoral.

Ese mismo año participa en el Torneo de ascenso "Simón Bolívar" donde se adjudica el subcampeonato (derrota por penales) ante Club Atlético Pompeya.

En su primera temporada en la liga jugó su primer partido ante The Strongest el 6 de febrero con resultado adverso 0:1.

En su retorno al torneo de la AFLP, en 2003 Mariscal Braun logra un nuevo subcampeonato tras perder la final ante La Paz F.C.

Los años 2005, 2006 y 2007 fueron inolvidables luego de conseguir el tricampeonato donde la escuadra “Cervecera” demostró hegemonía en el balompié paceño.