El problema era que Gall no utilizó un método científico adecuado a sus afirmaciones, y la Academia de Ciencias de París, actuando por orden del emperador Napoleón Bonaparte, pidió Flourens para resolver el asunto.

Mediante la eliminación de los hemisferios cerebrales, por ejemplo, todas las percepciones, la motricidad y el juicio fueron abolidos.

Por otra parte, no pudo (probablemente porque sus sujetos experimentales tienen cortezas relativamente primitivas) para encontrar regiones específicas para la memoria y la cognición, lo que le llevó a creer que están representados en una forma difusa en todo el cerebro.

Así, las diferentes funciones de hecho podrían ser atribuidos a regiones particulares del cerebro, pero que una localización más fina era deficiente.

Flourens fue elegido por Cuvier en 1828 para ofrecer un curso de conferencias sobre la historia natural en el Collège de France, y en el mismo año se convirtió, en la sucesión a LAG Bosc, un miembro del Instituto, en la división "rurale Económica."